Protein–RNA interactions for Protein: Q13835

PKP1, Plakophilin-1, humanhuman

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Length 747 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PKP1Q13835 RMDN1-202ENST00000430676 1106 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ARPC4-203ENST00000433034 926 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 IGHV3-65-201ENST00000523210 341 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MRPL49-206ENST00000531705 489 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL589182.1-202ENST00000548416 533 ntTSL 4 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TBCB-205ENST00000585746 875 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ING1-203ENST00000375774 2870 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RNF34-202ENST00000392464 1722 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LINC00937-207ENST00000544461 3033 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC138035.3-201ENST00000622706 2791 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CD68-201ENST00000250092 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DEF8-225ENST00000569453 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ABHD3-201ENST00000289119 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SKIDA1-202ENST00000449193 6598 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF568-203ENST00000427117 1827 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC25A45-214ENST00000534028 2432 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ITGA7-202ENST00000347027 4084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MCFD2-201ENST00000319466 4182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RPS5-202ENST00000596046 1520 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMPRSS2-206ENST00000458356 1701 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL109954.1-202ENST00000564051 2148 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 FGD5-201ENST00000285046 5720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF334-202ENST00000457685 3487 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DBNDD1-202ENST00000304733 2081 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMEM132E-201ENST00000321639 5631 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 KLF11-201ENST00000305883 4030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PBXIP1-201ENST00000368460 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GBGT1-201ENST00000372036 871 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SCARNA2-201ENST00000458748 420 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RNF146-204ENST00000476956 884 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC012640.2-201ENST00000561606 901 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL121772.3-201ENST00000610840 674 ntBASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ASAH1-210ENST00000520781 2245 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 API5-202ENST00000420461 2009 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC25A27-201ENST00000371347 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DPP6-205ENST00000427557 2388 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC012507.2-203ENST00000415628 1765 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PHYHD1-201ENST00000308941 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AP1M1-202ENST00000429941 1578 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PPM1H-201ENST00000228705 6353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC003986.2-201ENST00000419944 1711 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DDOST-201ENST00000375048 2079 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CRK-201ENST00000300574 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC2A9-201ENST00000264784 1850 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TBK1-201ENST00000331710 3256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PCTP-201ENST00000268896 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CYP21A2-221ENST00000418967 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GPN1-212ENST00000616939 1832 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AP002414.3-201ENST00000589352 1468 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PCDHA8-202ENST00000531613 5260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC100861.1-202ENST00000500853 1970 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GPR61-206ENST00000616874 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 GSTZ1-202ENST00000349555 867 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 COL8A2-202ENST00000397799 4670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 EEF1E1-202ENST00000429723 562 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 HCG4P8-203ENST00000443049 980 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 LINC01615-202ENST00000449466 603 ntTSL 3 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC091304.2-201ENST00000564639 760 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC027682.4-201ENST00000605277 798 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 RBBP8-201ENST00000327155 3288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC44A2-203ENST00000586078 3784 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 EDA-204ENST00000374553 5272 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ANKRD23-201ENST00000318357 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 MVK-207ENST00000539575 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZC2HC1C-201ENST00000238686 2249 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 DMTN-204ENST00000415253 2394 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 PLA2G2D-202ENST00000617227 1856 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 NID2-208ENST00000617139 3827 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SLC25A35-205ENST00000580340 1541 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC091951.1-201ENST00000512854 2465 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AL928970.1-201ENST00000422679 2923 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 ZNF777-201ENST00000247930 3233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
PKP1Q13835 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
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