Protein–RNA interactions for Protein: Q13761

RUNX3, Runt-related transcription factor 3, humanhuman

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Length 415 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RUNX3Q13761 GNAS-212ENST00000371098 1719 ntTSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 HR-202ENST00000381418 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.24
RUNX3Q13761 SGSM2-201ENST00000268989 4863 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FO681492.1-201ENST00000623662 5321 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PLCB2-201ENST00000260402 4616 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LINC01168-201ENST00000461291 5254 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ACTL9-201ENST00000324436 1426 ntAPPRIS P1 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HDAC10-201ENST00000216271 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 EHMT1-236ENST00000637161 5049 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TJP3-201ENST00000539908 2897 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.52■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 EIF3B-201ENST00000360876 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 YY1-201ENST00000262238 6697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DHX33-202ENST00000433302 2225 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIDN-206ENST00000591446 3243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PARP15-202ENST00000464300 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ZNF302-201ENST00000423823 2590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NOV-201ENST00000259526 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GTPBP2-202ENST00000307126 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RAPH1-211ENST00000457812 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TNRC18-202ENST00000399434 1459 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SDHB-201ENST00000375499 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TPSD1-202ENST00000397534 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL161908.2-201ENST00000457964 394 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TMEM261P1-201ENST00000604899 340 ntBASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SH3BP4-202ENST00000392011 5194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SMG5-201ENST00000361813 4559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NOL4L-205ENST00000375678 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NRXN1-202ENST00000342183 3315 ntTSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FCHO1-201ENST00000252771 3118 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FAM184A-201ENST00000338891 4141 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 IPMK-201ENST00000373935 6133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.51■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RABEPK-206ENST00000628863 1537 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 P2RY6-208ENST00000540124 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ADARB1-204ENST00000389863 3563 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PODNL1-202ENST00000339560 2165 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SLC41A3-203ENST00000360370 2169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TBX6-203ENST00000553607 2162 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MIER1-206ENST00000371016 1802 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MEIS3-206ENST00000559524 1828 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CTCFL-215ENST00000608158 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 FAM213B-205ENST00000444521 2827 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 NARFL-218ENST00000568545 2486 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CLCN6-207ENST00000376497 814 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SQSTM1-202ENST00000389805 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PABPN1L-201ENST00000411789 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AL157832.1-201ENST00000428273 495 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 C9orf41-AS1-201ENST00000455609 719 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC008969.1-205ENST00000553254 876 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RARRES2P5-201ENST00000564013 466 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 APOC4-201ENST00000591600 348 ntTSL 3 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 OPA3-202ENST00000323060 2250 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 TEAD2-203ENST00000539846 1444 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HMGA1-204ENST00000401473 1887 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 COL4A2-201ENST00000360467 6281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 CTNNAL1-204ENST00000374595 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 EXT2-202ENST00000358681 2997 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SLC35E4-201ENST00000343605 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 RIC8B-213ENST00000638198 1611 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 GTF2IP4-202ENST00000544802 3609 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 SYTL3-202ENST00000360448 2504 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ARL6IP6-201ENST00000326446 2805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 OSBP2-211ENST00000446658 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ZBTB5-201ENST00000307750 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ATP6V0B-201ENST00000236067 944 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC114730.3-201ENST00000435195 584 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 ATP6V0B-211ENST00000498664 825 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 OXCT1-AS1-201ENST00000508458 1731 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
RUNX3Q13761 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
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