Protein–RNA interactions for Protein: Q13620

CUL4B, Cullin-4B, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL4BQ13620 ARL6IP1-201ENST00000304414 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 VILL-207ENST00000465644 1857 ntTSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DACT1-202ENST00000395153 3734 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AXIN2-202ENST00000375702 2541 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PAPOLB-201ENST00000404991 4262 ntAPPRIS P1 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 COMMD5-202ENST00000402718 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LTBP2-205ENST00000556690 5614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 RAB40B-206ENST00000571995 3859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 C22orf39-201ENST00000333059 1221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FAM19A5-204ENST00000406880 833 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC013270.1-201ENST00000425578 440 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NDUFA6-AS1-203ENST00000439129 2950 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CMPK1-205ENST00000471289 816 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HS6ST1P1-201ENST00000481504 1234 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DDIAS-202ENST00000524921 607 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HOXD8-204ENST00000544999 1235 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 C12orf76-202ENST00000546627 461 ntTSL 4 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PMF1-BGLAP-204ENST00000567140 655 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC011476.2-201ENST00000585492 1271 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NME4-212ENST00000621774 904 ntTSL 3 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PTK6-202ENST00000542869 2931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ATG13-216ENST00000530500 2030 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TUBA4B-203ENST00000490341 1380 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PITPNA-201ENST00000313486 3912 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AMN1-201ENST00000281471 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PEG3-206ENST00000598410 5304 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NR1H3-204ENST00000407404 1330 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 U82695.1-201ENST00000635752 1889 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SCNN1A-221ENST00000543768 2361 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BEX3-201ENST00000361298 921 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SATB1-AS1-201ENST00000414198 737 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SPDYE2-202ENST00000432940 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SPDYE2B-201ENST00000436228 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC131097.3-202ENST00000439270 331 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 FIS1-203ENST00000442303 631 ntTSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PRSS21-202ENST00000450020 1106 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SPDYE5-201ENST00000455862 1209 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HILS1-201ENST00000504307 1219 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 EFCAB1-209ENST00000523092 648 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC025162.1-201ENST00000554022 565 ntTSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC106730.1-201ENST00000566722 1090 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CDC42EP4-206ENST00000581014 737 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MKNK2-212ENST00000591588 631 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC140113.2-201ENST00000604370 208 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MGRN1-201ENST00000262370 3968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 PCNX3-201ENST00000355703 7105 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 LOXL3-203ENST00000409249 2431 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BRF1-206ENST00000446501 2858 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SEMA4B-202ENST00000411539 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 NDUFB2-AS1-201ENST00000465466 1648 ntTSL 2 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 MGME1-201ENST00000377704 1781 ntTSL 3 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 KCND3-202ENST00000315987 2716 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 IFNL1-201ENST00000333625 857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 C6orf226-201ENST00000408925 552 ntAPPRIS P1 BASIC18.28■□□□□ 0.52
CUL4BQ13620 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
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