Protein–RNA interactions for Protein: Q13618

CUL3, Cullin-3, humanhuman

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Length 768 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CUL3Q13618 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TSPAN14-210ENST00000616406 2436 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CDIP1-209ENST00000567695 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TLCD1-201ENST00000292090 1017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IPPK-202ENST00000375522 882 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 VPS13A-AS1-201ENST00000415172 519 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LINC02247-201ENST00000417135 743 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 XXYLT1-205ENST00000437101 2149 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 JPH4-203ENST00000544177 1124 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC139887.3-201ENST00000568585 713 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC022150.1-201ENST00000599222 640 ntTSL 3 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AL139424.1-201ENST00000607572 797 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ABHD10-201ENST00000273359 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 WDR20-202ENST00000322340 3060 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TMEM161A-201ENST00000162044 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SMAP1-201ENST00000316999 2403 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AL596087.1-201ENST00000400979 1969 ntBASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AP001372.2-201ENST00000526036 2493 ntTSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KCTD7-206ENST00000639828 5951 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TK2-221ENST00000620035 5060 ntTSL 2 BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.35■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ALPL-204ENST00000374840 2589 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PATZ1-203ENST00000351933 3638 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CAMKK2-203ENST00000347034 5218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 WDR1-205ENST00000502702 1691 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CAMKK2-211ENST00000538733 5175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ZNF84-202ENST00000392319 7020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ARHGEF6-202ENST00000370620 4764 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BRD2-202ENST00000374831 4807 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HNRNPA1-202ENST00000340913 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BCL9L-202ENST00000526143 5514 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CCDC107-201ENST00000327351 804 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BAG1-202ENST00000379704 1128 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 YDJC-202ENST00000398873 1066 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 AL031587.1-201ENST00000410099 1055 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CHCHD3-203ENST00000448878 1038 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
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CUL3Q13618 RNF151-202ENST00000569210 853 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SHH-201ENST00000297261 4454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 DNASE2-201ENST00000222219 1955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 Z99756.1-201ENST00000458463 1951 ntTSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 PDCL3-201ENST00000264254 1337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TNFAIP3-207ENST00000614035 1430 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BCAS3-204ENST00000585744 2203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ALDH3A2-225ENST00000630662 1558 ntTSL 5 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 BANP-203ENST00000393207 2438 ntTSL 2 BASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.34■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CICP14-201ENST00000629111 2732 ntBASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 CLCF1-201ENST00000312438 1844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 ZNF451-201ENST00000357489 4998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.21
CUL3Q13618 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 NOS1AP-205ENST00000493151 5559 ntTSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 MIR202HG-201ENST00000300167 384 ntTSL 2 BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 PRSS27-201ENST00000302641 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 ZNHIT1-201ENST00000305105 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.33■□□□□ 0.2
CUL3Q13618 HIST2H3DP1-201ENST00000401004 416 ntBASIC16.33■□□□□ 0.2
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