Protein–RNA interactions for Protein: Q13393

PLD1, Phospholipase D1, humanhuman

Predictions only

Length 1,074 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD1Q13393 SLC10A3-204ENST00000393587 1862 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ATXN2-219ENST00000550104 4648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 DNAJB8-AS1-201ENST00000471626 1798 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 WDR45-239ENST00000634944 1745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC005622.1-201ENST00000636801 1703 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MARCH2-208ENST00000602117 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 RNF157-202ENST00000319945 2937 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 HCN1-201ENST00000303230 9885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 GPD2-201ENST00000310454 6041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ZNF232-201ENST00000250076 2179 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CLDN11-201ENST00000064724 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ZNF451-203ENST00000370706 5268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CLUH-201ENST00000435359 5224 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TUBGCP3-202ENST00000375669 2723 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AP3D1-202ENST00000355272 5034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PIGT-207ENST00000543458 2037 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MGAT1-203ENST00000393340 3077 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 BATF2-202ENST00000435842 1949 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SH2B1-216ENST00000618521 2935 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MARCO-201ENST00000327097 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PHKA1-205ENST00000541944 5944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 DLGAP4-205ENST00000401952 4881 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ACRV1-201ENST00000315608 1042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 EEF1D-207ENST00000524624 1084 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SPATA8-AS1-201ENST00000558722 465 ntTSL 3 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AL132655.2-201ENST00000596276 594 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SCAMP4-201ENST00000316097 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PTP4A1-201ENST00000370651 5088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 GOLGA2P3Y-201ENST00000416946 1653 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 APBB2-204ENST00000502841 1681 ntTSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SHISA5-219ENST00000612611 1677 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 GGT7-201ENST00000336431 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SIRT6-202ENST00000337491 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ZNF324-203ENST00000536459 5653 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SCN3B-202ENST00000392770 6061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TRPV4-207ENST00000541794 2475 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SLC2A14-202ENST00000396589 2335 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 HDHD3-202ENST00000374180 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 KRT12-201ENST00000251643 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TLE2-204ENST00000455444 2253 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 CDK8-201ENST00000381527 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ZNF853-201ENST00000457543 3857 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AL391825.1-201ENST00000457671 1364 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PRDM8-203ENST00000504452 3706 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 STX17-205ENST00000525640 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PKM-216ENST00000565184 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 WWTR1-201ENST00000360632 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 LSM12-204ENST00000591247 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TRPV4-205ENST00000537083 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 EVI5L-202ENST00000538904 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 TMC4-209ENST00000617472 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 FBXO4-201ENST00000281623 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ASTN2-205ENST00000361209 4622 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 H1FOO-201ENST00000324382 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 RN7SL692P-201ENST00000464677 288 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 VAT1-205ENST00000587173 1174 ntTSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 MIR4321-201ENST00000592276 80 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 LCN8-205ENST00000612714 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
PLD1Q13393 PYGL-201ENST00000216392 3048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.8 ms