Protein–RNA interactions for Protein: Q13258

PTGDR, Prostaglandin D2 receptor, humanhuman

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Length 359 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGDRQ13258 FIGLA-201ENST00000332372 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LINC00398-201ENST00000414407 906 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PIK3CD-AS2-201ENST00000415330 939 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MKNK2P1-201ENST00000437526 628 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CR559946.1-201ENST00000453835 531 ntTSL 4 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL390729.1-201ENST00000456651 587 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C8orf46-205ENST00000480005 865 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 KRT8P48-201ENST00000515599 1220 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BCL2L12-206ENST00000598306 510 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MXI1-202ENST00000332674 3470 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DMRTC2-201ENST00000269945 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PLTP-204ENST00000420868 1420 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 YTHDF2-209ENST00000542507 2825 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DNAAF2-201ENST00000298292 2963 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FOXO1B-201ENST00000504678 1527 ntBASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 VPS16-203ENST00000380469 2318 ntTSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.54■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SYT15-202ENST00000374323 6428 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LRRN2-203ENST00000367177 3463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DCD-201ENST00000293371 645 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AURKAIP1-201ENST00000321751 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RPS17-201ENST00000330244 592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ROMO1-201ENST00000336695 496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CD82-202ENST00000342935 967 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CLIC1-208ENST00000375784 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NDUFA4L2-201ENST00000393825 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AP1S3-202ENST00000396653 589 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PTPRN2-205ENST00000409483 4711 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ACTG1P14-201ENST00000446382 1122 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 LINC01640-201ENST00000452505 550 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC027307.2-201ENST00000591252 911 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC010619.2-201ENST00000595815 1421 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC026120.1-201ENST00000611536 926 ntBASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 HNRNPH1-250ENST00000630639 123 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ZNF799-201ENST00000419318 3036 ntTSL 2 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CROCCP3-201ENST00000263511 5368 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BHLHE41-201ENST00000242728 3837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MFF-202ENST00000337110 1760 ntTSL 1 (best) BASIC18.53■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RHD-207ENST00000454452 1303 ntTSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 MICALL2-201ENST00000297508 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 KRT2-201ENST00000309680 2403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GIT2-220ENST00000553118 2424 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ANTXR1-201ENST00000303714 5859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 GFM1-208ENST00000478576 2147 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 COQ10A-202ENST00000433805 1410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 DENR-201ENST00000280557 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SLC5A6-203ENST00000408041 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 SDC4-201ENST00000372733 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 RPS27A-201ENST00000272317 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 ITGB2-204ENST00000397846 422 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 CYTH4-203ENST00000405206 636 ntTSL 4 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 BX842568.4-201ENST00000421222 227 ntBASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 C6orf47-AS1-203ENST00000422049 673 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 COX10-202ENST00000429152 875 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 EHMT1-216ENST00000493484 1182 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 TWSG1-202ENST00000581641 1119 ntTSL 2 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
PTGDRQ13258 AC004832.1-201ENST00000610936 1005 ntTSL 5 BASIC18.52■□□□□ 0.56
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