Protein–RNA interactions for Protein: Q13049

TRIM32, E3 ubiquitin-protein ligase TRIM32, humanhuman

Predictions only

Length 653 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM32Q13049 LMNA-205ENST00000368299 2253 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MCF2L-208ENST00000397030 6580 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 C12orf65-202ENST00000366329 1901 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AFMID-201ENST00000327898 1700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 IMP3-201ENST00000314852 2028 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CD40-201ENST00000372276 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 DCLK2-204ENST00000506325 2298 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MYO9A-214ENST00000566885 5111 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CHRNA4-207ENST00000615287 5643 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MRPS30-202ENST00000507110 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 IFNL2-201ENST00000331982 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LCE1E-202ENST00000368771 575 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NUDT1-205ENST00000397048 783 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GOLGA2P4-201ENST00000441462 777 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RCAN1-212ENST00000492600 935 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NDUFA4L2-206ENST00000556732 883 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC103810.3-201ENST00000583567 96 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC003070.2-201ENST00000589730 386 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RIC8A-217ENST00000626818 159 ntTSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 GALNT14-202ENST00000349752 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KCNC4-204ENST00000438661 2953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TXNRD2-218ENST00000542719 2024 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CHTOP-201ENST00000368686 2250 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ARFIP2-201ENST00000254584 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 IGHA1-202ENST00000641837 1310 ntAPPRIS P5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC067852.2-201ENST00000590513 2313 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TRAK1-209ENST00000487159 5536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NHEG1-202ENST00000432330 1357 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FAM172A-204ENST00000505869 1387 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 Z97205.2-201ENST00000564697 1639 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PEA15-202ENST00000368076 2694 ntTSL 2 BASIC18.16■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 C19orf48-202ENST00000391812 1666 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 LTBR-207ENST00000539925 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NFIA-205ENST00000371189 1989 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RUNX2-202ENST00000371432 5487 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PTHLH-209ENST00000545234 1544 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC007952.1-202ENST00000399083 1173 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 DMKN-204ENST00000408915 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RPL7P3-201ENST00000441388 714 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CRYGN-205ENST00000491928 698 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC010491.1-202ENST00000567048 528 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC244517.4-201ENST00000624549 580 ntTSL 4 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 KISS1-202ENST00000625357 435 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 AC106017.2-201ENST00000631194 1173 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 FGFR4-202ENST00000393637 2418 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF500-202ENST00000545009 2440 ntTSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MFSD2A-202ENST00000372811 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 CACTIN-201ENST00000221899 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ANKRD29-208ENST00000592179 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MEIKIN-203ENST00000442687 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF773-201ENST00000282292 2206 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 PIGZ-202ENST00000412723 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 RNF166-203ENST00000541206 2419 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ACP2-205ENST00000527256 1499 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZNRF2-201ENST00000323037 3460 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
TRIM32Q13049 ARHGEF4-206ENST00000428230 2172 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 CRTC3-201ENST00000268184 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 SLC12A4-201ENST00000316341 4765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 KIAA1549-201ENST00000422774 6283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 DBNDD2-208ENST00000372723 1118 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 APOC3-202ENST00000375345 604 ntTSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 SETD4-205ENST00000399208 1165 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AL442647.2-201ENST00000429864 857 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 ROPN1B-210ENST00000514116 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AP001889.1-201ENST00000525414 633 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AGER-214ENST00000538695 487 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AC079336.2-201ENST00000578408 927 ntTSL 3 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AC010336.6-201ENST00000595107 528 ntTSL 4 BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AGER-215ENST00000620802 737 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 AL139099.5-201ENST00000635274 300 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
TRIM32Q13049 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 93.9 ms