Protein–RNA interactions for Protein: Q12923

PTPN13, Tyrosine-protein phosphatase non-receptor type 13, humanhuman

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Length 2,485 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTPN13Q12923 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PNOC-204ENST00000522209 1007 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC068397.2-201ENST00000558742 341 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC092139.2-201ENST00000563750 754 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LINC02109-201ENST00000565798 869 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 GOLGA2P9-203ENST00000600260 2033 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NPTX2-201ENST00000265634 2700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CTSD-212ENST00000637815 2003 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SLC25A48-201ENST00000274513 1880 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 HARBI1-201ENST00000326737 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 WRAP73-202ENST00000378322 1998 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 KDSR-201ENST00000326575 1024 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RPSAP31-201ENST00000416648 895 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LINC01006-204ENST00000435354 545 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AP000552.1-208ENST00000452952 576 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NUP210P1-202ENST00000504322 710 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CYBA-208ENST00000567174 1085 ntTSL 2 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MIR3147-201ENST00000577811 66 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SIGLEC29P-201ENST00000599873 1114 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 KCTD14-201ENST00000353172 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SNRPN-202ENST00000390687 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC015818.8-201ENST00000587907 1519 ntBASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RUSC2-202ENST00000455600 5636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 OLFM1-201ENST00000252854 2591 ntTSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MRGPRX3-201ENST00000396275 1639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 INPP4A-201ENST00000074304 6752 ntTSL 5 BASIC14.01□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TACSTD2-201ENST00000371225 2351 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SHISA3-201ENST00000319234 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SCYL1-203ENST00000420247 2583 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL355312.1-201ENST00000407115 2176 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FAM239A-202ENST00000438107 2155 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ESPN-216ENST00000636330 4731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DLGAP4-206ENST00000475894 3110 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PPP2R1B-203ENST00000393055 1525 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RNF186-201ENST00000375121 1250 ntAPPRIS P1 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FKBP2-203ENST00000449942 613 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SIAH2-AS1-201ENST00000461943 441 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 SERPINA13P-202ENST00000478994 924 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 RPSAP36-202ENST00000494591 1261 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MIR4741-201ENST00000579822 90 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC061975.2-201ENST00000581722 295 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL160412.1-202ENST00000616819 663 ntTSL 4 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 GGT3P-201ENST00000412448 2340 ntTSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 STRBP-201ENST00000348403 3337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 COX20-203ENST00000411948 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ZNF281-202ENST00000367352 2933 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AURKA-202ENST00000347343 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ZNF446-201ENST00000335841 1889 ntTSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FRMD8P1-201ENST00000440433 1524 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MCOLN2-201ENST00000284027 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PSMB4-201ENST00000290541 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PSMG4-203ENST00000380306 726 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FOXP4-AS1-203ENST00000439386 404 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC068134.1-201ENST00000441266 481 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 DNAJC27-AS1-207ENST00000451291 488 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC018680.1-202ENST00000500324 525 ntTSL 3 BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC044849.1-201ENST00000519737 1188 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NPM1P43-201ENST00000558669 786 ntBASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ACTB-201ENST00000331789 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ARHGAP44-203ENST00000379672 4228 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LSP1-217ENST00000612798 1881 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TXNL4A-201ENST00000269601 3504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 KCNMA1-278ENST00000640141 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PDE8A-202ENST00000339708 2663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LSS-205ENST00000457828 4390 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 MIB2-219ENST00000505820 3305 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 PGGT1B-202ENST00000379615 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 NPPC-202ENST00000409852 1051 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LINC01067-201ENST00000432575 664 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 LINC01629-201ENST00000553613 581 ntTSL 4 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 TBCB-211ENST00000589996 724 ntTSL 3 BASIC13.99□□□□□ -0.17
PTPN13Q12923 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC13.99□□□□□ -0.17
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