Protein–RNA interactions for Protein: Q12857

NFIA, Nuclear factor 1 A-type, humanhuman

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Length 509 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NFIAQ12857 TMEM14DP-201ENST00000422205 345 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FADS2-205ENST00000517839 469 ntTSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 MIR6752-201ENST00000618442 71 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SEPHS1-202ENST00000378614 2387 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PHLDA1-202ENST00000602540 5741 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC080080.1-201ENST00000625121 2420 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 PLCB3-204ENST00000540288 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SSC5D-202ENST00000587166 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SLC47A1-209ENST00000575023 2224 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LPAR5-202ENST00000431922 2695 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 HIST1H2AC-203ENST00000602637 1462 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 VEZF1-202ENST00000581208 2321 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SPC24-206ENST00000592540 2315 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TMUB2-209ENST00000587989 1969 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GSKIP-207ENST00000556095 3834 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AADAT-208ENST00000515480 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 VHL-202ENST00000345392 2696 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LAPTM4B-201ENST00000445593 3173 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TAAR5-201ENST00000258034 1014 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC093423.3-201ENST00000370453 654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC112492.5-201ENST00000421897 457 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL161785.3-201ENST00000435157 395 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 HMGB2-203ENST00000446922 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC011495.1-201ENST00000498085 584 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC129507.1-201ENST00000570711 1013 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LINC01115-203ENST00000606068 577 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AC093726.1-201ENST00000608064 963 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL162274.1-201ENST00000617191 1098 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 NOS1AP-206ENST00000530878 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RCC1-202ENST00000373832 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 DNM2-201ENST00000355667 3541 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GLMP-213ENST00000612353 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GLMP-215ENST00000622703 1364 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RANBP10-201ENST00000317506 5341 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 RANBP10-209ENST00000630626 5305 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TMEM140-201ENST00000275767 1997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TBXAS1-210ENST00000458722 2057 ntTSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 ADAMTS19-201ENST00000274487 5234 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 OTUB1-202ENST00000422031 2297 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 TNPO2-201ENST00000356861 4962 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 GOLGA6L2-204ENST00000567107 3030 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 IKZF4-206ENST00000547791 1712 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 CADPS-201ENST00000283269 4591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.66
NFIAQ12857 APOPT1-201ENST00000409074 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PRRC2A-201ENST00000376007 6861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SFTPB-202ENST00000409383 1867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AC009292.1-201ENST00000502156 1986 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SPSB4-201ENST00000310546 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MRPL55-206ENST00000366732 722 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NAA10-201ENST00000370009 837 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NAA10-203ENST00000370015 1002 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZNF707-203ENST00000442058 562 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RCHY1-210ENST00000513257 759 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 IL32-215ENST00000529550 772 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 MUTYH-237ENST00000531105 501 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 AP000943.3-201ENST00000536540 954 ntTSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 LINC01975-201ENST00000571890 549 ntTSL 4 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PIH1D1-209ENST00000596049 992 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 WFDC1-204ENST00000613603 549 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SLC9A6-208ENST00000636206 4711 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CARNS1-202ENST00000445895 3971 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CALM3-212ENST00000599839 1355 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 USP25-204ENST00000400183 5341 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NTNG1-202ENST00000370065 1485 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RALY-203ENST00000375114 6430 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ADSL-202ENST00000342312 1808 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ZNRF3-203ENST00000544604 6851 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 DPY19L2P4-202ENST00000497063 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SPAG1-201ENST00000251809 3748 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 SLC29A1-208ENST00000393844 2326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 STXBP3-201ENST00000370008 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
NFIAQ12857 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
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