Protein–RNA interactions for Protein: Q12809

KCNH2, Potassium voltage-gated channel subfamily H member 2, humanhuman

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Length 1,159 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
KCNH2Q12809 DPY30-201ENST00000295066 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 DPY30-202ENST00000342166 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AFG3L1P-210ENST00000431757 569 ntTSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC104532.1-201ENST00000588891 580 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 IRF1-211ENST00000613424 821 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 NKX3-1-201ENST00000380871 3271 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TMC5-202ENST00000381414 4755 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SLC27A6-201ENST00000262462 3219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 IER2-203ENST00000588173 2934 ntAPPRIS P1 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SBSN-201ENST00000452271 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CFAP43-203ENST00000369719 1434 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ANAPC13-206ENST00000514612 1420 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TUBB4A-201ENST00000264071 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SPAG9-205ENST00000505279 4659 ntTSL 1 (best) BASIC17.8■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ZFP90-203ENST00000563169 2512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SCAF1-201ENST00000360565 4306 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 C1RL-210ENST00000544702 1569 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CBWD1-201ENST00000314367 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 MAST3-201ENST00000262811 5896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AL162727.3-201ENST00000635661 2787 ntBASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TEX30-205ENST00000376029 959 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 AL359317.2-203ENST00000557409 538 ntTSL 4 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 TLE2-203ENST00000443826 2238 ntTSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SFXN1-201ENST00000321442 4231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 MTCL1-205ENST00000517570 6009 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 LCK-201ENST00000333070 2166 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SLC9A2-201ENST00000233969 5410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CLN3-216ENST00000565316 1318 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 CST3-201ENST00000376925 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 IGFLR1-205ENST00000588992 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.78■□□□□ 0.44
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KCNH2Q12809 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC139530.3-201ENST00000620344 690 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AL161645.1-201ENST00000622716 1255 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ATXN2-201ENST00000377617 4702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 ASS1-204ENST00000372394 1973 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AFG3L2-201ENST00000269143 3247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 CLDND1-222ENST00000510545 2124 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 FAM60A-203ENST00000454658 1555 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SATB1-201ENST00000338745 7810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
KCNH2Q12809 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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