Protein–RNA interactions for Protein: Q12805

EFEMP1, EGF-containing fibulin-like extracellular matrix protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 493 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFEMP1Q12805 AC093214.1-201ENST00000511688 1107 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 INS-205ENST00000512523 297 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AJ003147.2-201ENST00000576468 629 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ZNF550-208ENST00000601415 515 ntTSL 4 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC138649.4-201ENST00000612222 287 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PAK4-202ENST00000358301 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CES3-203ENST00000543856 3178 ntTSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PPP2R2B-206ENST00000453001 2569 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TONSL-203ENST00000613741 1713 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PMS1-206ENST00000418224 3018 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SSPN-201ENST00000242729 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MYO1D-201ENST00000318217 5563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CNTRL-208ENST00000373865 1917 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 LZTS3-202ENST00000337576 4238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ACTG1-208ENST00000575087 2001 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 C8orf76-201ENST00000276704 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GIMAP1-201ENST00000307194 4420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CLYBL-203ENST00000376355 6771 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 QPCTL-201ENST00000012049 2310 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ADAMTSL5-201ENST00000330475 2857 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AASDHPPT-201ENST00000278618 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CD14-202ENST00000401743 1648 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NID1-202ENST00000366595 5412 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AL079303.2-201ENST00000555107 2613 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 POP7-201ENST00000303151 927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CXCL12-206ENST00000395795 404 ntTSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 LINC00473-203ENST00000581850 929 ntTSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 HEXIM2-206ENST00000591576 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 AMFR-201ENST00000290649 3600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SEMA3B-213ENST00000618865 2925 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
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EFEMP1Q12805 CDKN1B-201ENST00000228872 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CALCR-207ENST00000426151 1741 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ADAM8-205ENST00000485491 2441 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MAN1C1-201ENST00000263979 2627 ntTSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 CCDC84-201ENST00000334418 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 HDAC8-202ENST00000373556 704 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC022167.4-201ENST00000570290 498 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AC105021.1-202ENST00000570572 669 ntBASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 COQ4-205ENST00000609948 956 ntTSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ANKRD2-203ENST00000370655 1451 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 TADA1-201ENST00000367874 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 MAPT-201ENST00000262410 6762 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 PLCB1-203ENST00000378641 7323 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
EFEMP1Q12805 ABCG5-201ENST00000260645 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
EFEMP1Q12805 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
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