Protein–RNA interactions for Protein: Q02318

CYP27A1, Sterol 26-hydroxylase, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 531 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYP27A1Q02318 ACP5-212ENST00000592828 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
CYP27A1Q02318 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 CNOT3-204ENST00000447684 2765 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 GGT4P-201ENST00000623672 1708 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TUBB-206ENST00000330914 2632 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 FANCA-203ENST00000389302 1641 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 COQ8B-201ENST00000243583 2041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ALG1L5P-201ENST00000482043 771 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 UBXN1-210ENST00000529640 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC005606.1-201ENST00000567515 504 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TNFRSF13B-203ENST00000579315 600 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 BSG-214ENST00000614867 960 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AL121832.1-201ENST00000615180 677 ntTSL 3 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC055717.3-201ENST00000622967 595 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC012485.3-201ENST00000637634 2424 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 BANP-217ENST00000479780 1551 ntTSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 REM2-202ENST00000536884 1331 ntTSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PRKD2-214ENST00000600194 2923 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 FADS3-207ENST00000527697 1640 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ARID5A-201ENST00000357485 2188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PCGF1-201ENST00000233630 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MTERF2-201ENST00000240050 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 HARS-204ENST00000438307 1789 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PRMT5-203ENST00000397440 1907 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 CPEB2-204ENST00000382401 5509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NFIX-210ENST00000588228 1692 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 DDT-204ENST00000404092 805 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ZNF295-AS1-202ENST00000429739 783 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NECTIN3-AS1-204ENST00000476301 568 ntTSL 4 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NT5C3B-215ENST00000521789 993 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC005829.1-201ENST00000570002 483 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC005412.3-201ENST00000580309 715 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC010624.2-201ENST00000600998 575 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SP100-204ENST00000409341 1898 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 IQCF5-AS1-201ENST00000440723 2000 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TFR2-202ENST00000431692 2631 ntTSL 5 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SALL4-203ENST00000395997 1918 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ACIN1-205ENST00000457657 4815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TATDN3-214ENST00000532324 1381 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PSMC3IP-204ENST00000587209 1381 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NFATC4-210ENST00000554050 3057 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 KDM6A-202ENST00000382899 5789 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SCP2-201ENST00000371509 1889 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SLAIN2-201ENST00000264313 6299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NOMO2-203ENST00000543392 3765 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TNNT1-201ENST00000291901 967 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RPLP2-201ENST00000321153 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PNRC2-202ENST00000374468 814 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 COA5-202ENST00000409997 557 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RNF212-203ENST00000433731 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 LINC01705-201ENST00000438158 562 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AL669831.5-202ENST00000457084 566 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AC068137.2-201ENST00000605408 478 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 AL691403.2-201ENST00000618460 490 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 C20orf181-201ENST00000623918 480 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
CYP27A1Q02318 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.3 ms