Protein–RNA interactions for Protein: Q01892

SPIB, Transcription factor Spi-B, humanhuman

Predictions only

Length 262 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPIBQ01892 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMEM106C-214ENST00000550161 976 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AHSA1-208ENST00000555517 832 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SDCCAG3P1-201ENST00000589292 1150 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL732292.2-201ENST00000609649 430 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KHDC1-207ENST00000610435 1101 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DHRS4L2-211ENST00000621761 1049 ntTSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AP000550.4-202ENST00000639755 178 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RCN2-203ENST00000394885 6347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GOLGA7B-201ENST00000370602 6447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC099508.1-201ENST00000499110 1666 ntTSL 4 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC39A1-203ENST00000368621 2398 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NEK11-210ENST00000510769 2149 ntTSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CLEC18A-203ENST00000449317 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MAPK3-212ENST00000484663 2567 ntTSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 COL26A1-201ENST00000313669 3033 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARMC5-204ENST00000538189 3017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.25■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DNAJB9-201ENST00000249356 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC005064.1-201ENST00000422488 2725 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BNIP2-201ENST00000267859 6325 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ORMDL1-203ENST00000392350 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ABCB8-211ENST00000477092 1596 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 C6orf223-201ENST00000336600 3581 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PDHX-203ENST00000448838 2653 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 NDUFB9-206ENST00000522532 1319 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC023830.1-201ENST00000569678 1543 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 B3GAT1-201ENST00000312527 3652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PEPD-201ENST00000244137 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MPL-201ENST00000372470 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 REEP2-211ENST00000613650 1944 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PSCA-201ENST00000301258 1020 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GJC3-201ENST00000312891 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AKR7L-201ENST00000420396 1240 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 IFT27-205ENST00000433985 1095 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ZNF346-205ENST00000506693 1276 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SFTPC-204ENST00000520605 519 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LINC02237-202ENST00000521904 477 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SFTPC-210ENST00000524255 681 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SSSCA1-206ENST00000531405 879 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC021739.5-201ENST00000558637 494 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 BLOC1S6-214ENST00000567461 1052 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC016876.1-204ENST00000573187 679 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ARMC7-204ENST00000582136 1204 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LINC01956-202ENST00000584273 612 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MTDHP3-201ENST00000594186 672 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LDHAL6A-203ENST00000615355 1042 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC008567.3-202ENST00000619671 859 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AC004706.3-202ENST00000621574 984 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 AL161772.1-201ENST00000610494 4412 ntBASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MAGI1-216ENST00000497477 3555 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ERP29-203ENST00000546477 1698 ntTSL 3 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SRPK1-204ENST00000373825 4592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RBM14-202ENST00000393979 1426 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TMEM97-201ENST00000226230 2568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.24■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 TNFRSF14-AS1-201ENST00000416860 3522 ntTSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CDK18-201ENST00000360066 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 RASGRP2-201ENST00000354024 2310 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 EIF4G1-216ENST00000427845 5038 ntTSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 CLDN14-204ENST00000399137 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 SMIM10-201ENST00000330288 1536 ntAPPRIS P1 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 GMPPA-204ENST00000373908 1501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.23■□□□□ 0.03
SPIBQ01892 MIF4GD-204ENST00000577542 1531 ntTSL 3 BASIC15.23■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.5 ms