Protein–RNA interactions for Protein: Q01524

DEFA6, Defensin-6, humanhuman

Predictions only

Length 100 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
DEFA6Q01524 TEKT5-201ENST00000283025 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CIRBP-202ENST00000413636 1606 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SIGIRR-220ENST00000531205 1649 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PML-211ENST00000564428 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GHDC-201ENST00000301671 2650 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SPAG9-222ENST00000618113 8246 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC079781.5-202ENST00000641784 3743 ntBASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TGIF2-202ENST00000373874 3432 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 MYC-207ENST00000621592 2366 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GABRB2-206ENST00000520240 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TRAK1-203ENST00000396175 5033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZFAND5-205ENST00000376962 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 AC244021.1-201ENST00000417218 3662 ntTSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 VWA2-203ENST00000603594 2600 ntTSL 2 BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KLF4-201ENST00000374672 2813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.59□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GGT6-204ENST00000574154 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CEP164-201ENST00000278935 5630 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 SPHK2-210ENST00000599748 2683 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 NEIL1-221ENST00000569035 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 ZNF561-AS1-204ENST00000587536 1799 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 GGT6-201ENST00000301395 2534 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.23
DEFA6Q01524 FNBP1-201ENST00000355681 1977 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NAGPA-201ENST00000312251 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PCDHA6-202ENST00000527624 2231 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AL022316.1-201ENST00000428765 572 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AKIRIN1-203ENST00000446189 1243 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC139713.2-206ENST00000499587 566 ntTSL 4 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NUTF2-206ENST00000569436 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC012645.4-201ENST00000610691 1061 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC005632.4-201ENST00000613759 431 ntTSL 3 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC132872.3-201ENST00000620937 629 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NECTIN3-211ENST00000493615 1876 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CTNS-202ENST00000381870 2470 ntTSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PDE8B-204ENST00000342343 2677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DOCK7-203ENST00000404627 2678 ntTSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ATG4B-205ENST00000404914 2878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KCNE3-201ENST00000310128 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ELL2P1-201ENST00000413990 1906 ntBASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SLC27A1-201ENST00000252595 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ACSM2A-201ENST00000219054 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CDC25C-207ENST00000513970 1968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PRPH-201ENST00000257860 3245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ABCC1-201ENST00000399408 6594 ntTSL 5 BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ABCC1-202ENST00000399410 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PSRC1-202ENST00000369904 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 WDR61-201ENST00000267973 1387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.58□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LZTR1-201ENST00000215739 4572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TMEM41B-204ENST00000528080 3968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 ZDHHC13-201ENST00000399351 2283 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 P2RY6-209ENST00000540342 1611 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TP53INP2-201ENST00000374809 4018 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 C14orf79-205ENST00000549240 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 COL11A2-202ENST00000361917 6104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GPX3-209ENST00000614343 1478 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 TOMM40L-201ENST00000367987 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SNAI3-201ENST00000332281 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 KLK8-202ENST00000320838 456 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 DDT-202ENST00000398344 713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CAMKMT-204ENST00000407131 652 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 GSAP-205ENST00000430584 600 ntTSL 5 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC106782.2-201ENST00000563252 992 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC010618.3-201ENST00000596643 775 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 AC005593.1-201ENST00000624894 515 ntBASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 EBLN3P-205ENST00000629870 958 ntTSL 3 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 CAP2-208ENST00000611958 2686 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SLC22A18-203ENST00000380574 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 MFRP-205ENST00000619721 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 HNRNPU-204ENST00000440865 3207 ntTSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 WASHC2C-208ENST00000537517 4417 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.57□□□□□ -0.24
DEFA6Q01524 SPIDR-201ENST00000297423 3988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.57□□□□□ -0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.4 ms