Protein–RNA interactions for Protein: P84074

HPCA, Neuron-specific calcium-binding protein hippocalcin, humanhuman

Predictions only

Length 193 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPCAP84074 KLHDC3-202ENST00000326974 1909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 TBRG4-202ENST00000361278 1917 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CCDC6-201ENST00000263102 5811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 LRRC14-205ENST00000529022 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ZNF7-201ENST00000325217 592 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 STEAP3-204ENST00000409811 2103 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 PGAP2-206ENST00000459679 795 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ARHGEF5-201ENST00000056217 5544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 LCE1C-202ENST00000607093 644 ntAPPRIS P2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CHST13-202ENST00000615522 1146 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AL355877.3-201ENST00000622820 899 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 SYT5-201ENST00000354308 3792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ZMYND15-202ENST00000433935 2411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 HSPA12B-201ENST00000254963 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 HOXB6-203ENST00000484302 1960 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 TMEM30A-201ENST00000230461 4594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 BNIP2-212ENST00000607373 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 VIPR2-202ENST00000377633 1491 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
HPCAP84074 SGK3-206ENST00000520976 2483 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ZBED1-201ENST00000381218 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 SYN1-202ENST00000340666 3172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 VSIG10-202ENST00000359236 4946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 TNFRSF13B-201ENST00000261652 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 HTD2-206ENST00000481972 1378 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 PAN3-AS1-201ENST00000563843 1351 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 MAPKAP1-201ENST00000265960 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 LSP1-202ENST00000381775 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CANT1-211ENST00000591773 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AL353997.2-201ENST00000579352 4955 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AL590787.1-201ENST00000568856 1315 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 HCG18-233ENST00000412685 2552 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CALD1-204ENST00000417172 1915 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 DBI-201ENST00000311521 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 IGF2-202ENST00000381392 1005 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 TSPY19P-201ENST00000418461 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 RPL13P5-203ENST00000421824 845 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 TSPY18P-201ENST00000441642 509 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 CT47A11-201ENST00000457020 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AC064862.7-201ENST00000604520 867 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 THSD1-202ENST00000349258 3189 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
HPCAP84074 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AL391256.1-201ENST00000443260 1855 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 HAND2-AS1-202ENST00000502896 5278 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ARHGEF1-219ENST00000599846 3393 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TMEM138-201ENST00000278826 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RRM1-214ENST00000534285 2075 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 APLNR-203ENST00000611099 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ITPK1-201ENST00000267615 6066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PAXBP1-202ENST00000331923 3995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PITPNM2-202ENST00000320201 6736 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 ZNF574-202ENST00000359044 2940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 BEND4-203ENST00000611697 1348 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PLAGL1-208ENST00000437412 2640 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 CCP110-201ENST00000381396 5446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MCRIP2-201ENST00000307650 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 HDDC3-201ENST00000330334 1047 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 PRSS38-201ENST00000366757 1267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 MRPL43-205ENST00000370234 798 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 DECR2-202ENST00000424398 1012 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AC125616.1-201ENST00000540369 1015 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 AP1S2-206ENST00000545766 576 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
HPCAP84074 RPL28-210ENST00000560583 1204 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39.4 ms