Protein–RNA interactions for Protein: P78414

IRX1, Iroquois-class homeodomain protein IRX-1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 480 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IRX1P78414 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TERC-201ENST00000602385 541 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC091076.1-201ENST00000610741 619 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TMEM114-203ENST00000620492 945 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 Metazoa_SRP.104-201ENST00000622099 280 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TMEM19-201ENST00000266673 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 ZNF252P-AS1-201ENST00000527067 3236 ntBASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 FBXO4-202ENST00000296812 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 TTC29-202ENST00000398886 1729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 LINC00887-203ENST00000429578 1717 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 CDK1-204ENST00000448257 1948 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
IRX1P78414 NR2E3-204ENST00000621736 2032 ntTSL 2 BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC023024.1-201ENST00000558838 2590 ntTSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ANKRD18A-201ENST00000399703 4041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CD8A-201ENST00000283635 2873 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CCAR2-202ENST00000389279 3980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 LDLR-204ENST00000545707 2429 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC007743.1-201ENST00000596663 3075 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CNKSR1-201ENST00000361530 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 JPT1-209ENST00000482348 1614 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC100830.1-201ENST00000560387 1609 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ATXN10-202ENST00000381061 3135 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BCRP2-201ENST00000398241 1842 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 C11orf80-203ENST00000525449 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM198B-203ENST00000585682 4900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GOSR2-201ENST00000225567 1245 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BEX4-201ENST00000372691 1066 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PLPP5-202ENST00000422581 853 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 UPK3BP1-201ENST00000428678 509 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CHCHD2P8-201ENST00000429873 447 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AP006284.1-202ENST00000527113 527 ntTSL 4 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM57A-205ENST00000572018 373 ntTSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL590235.2-202ENST00000602543 594 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TJP2-212ENST00000636438 4689 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AL365255.1-201ENST00000637702 847 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AQP8-201ENST00000219660 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ABHD14B-204ENST00000461108 1397 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PDLIM2-206ENST00000409141 1463 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PSMD6-210ENST00000492933 1495 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PRRT2-205ENST00000567659 1470 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AC107918.4-201ENST00000641966 3141 ntBASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TRIP10-201ENST00000313244 2153 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GDAP1L1-201ENST00000342560 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 XPO5-201ENST00000265351 5364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PSD-209ENST00000611678 3382 ntTSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
IRX1P78414 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GPER1-204ENST00000401670 1542 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 KNSTRN-201ENST00000249776 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DLX6-202ENST00000518156 2304 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CHRNB4-201ENST00000261751 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PSME3-202ENST00000441946 2944 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PAX3-203ENST00000344493 3109 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLC4A2-202ENST00000413384 4142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ARFGAP1-212ENST00000519604 3191 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 MCM3AP-AS1-203ENST00000421927 2280 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SLFNL1-201ENST00000302946 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 KRT8-205ENST00000546897 1755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 CSF3-202ENST00000331769 1673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PDE4DIP-230ENST00000530472 1690 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 DUS3L-202ENST00000320699 1355 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GID4-202ENST00000376345 1391 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AMZ2-203ENST00000392720 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PTPRN2-204ENST00000404321 1374 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 TOP3BP1-201ENST00000420768 1380 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SNRPA1-201ENST00000254193 1055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 FAM86B2-202ENST00000309608 806 ntTSL 3 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 SOD2-201ENST00000337404 991 ntTSL 2 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 AURKAIP1-202ENST00000338338 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 PTGDS-202ENST00000371625 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 GGT1-208ENST00000404920 657 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 VCX3B-203ENST00000444481 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
IRX1P78414 NT5C2-211ENST00000470299 249 ntTSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 51 ms