Protein–RNA interactions for Protein: P61421

ATP6V0D1, V-type proton ATPase subunit d 1, humanhuman

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP6V0D1P61421 PLCB1-201ENST00000338037 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RER1-202ENST00000378512 1404 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 LRRC20-206ENST00000395011 2903 ntTSL 4 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 TEX264-202ENST00000395057 1555 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 TMTC2-203ENST00000548305 2682 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SFTPA2-201ENST00000372325 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 MBD1-210ENST00000457839 2473 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 GABRB3-215ENST00000622697 5876 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RASA4-204ENST00000462172 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ZSCAN18-208ENST00000595944 1768 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 LHX5-201ENST00000261731 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 LINC02551-202ENST00000533812 2203 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 PDE4DIP-201ENST00000313431 5676 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ICAM4-203ENST00000393717 1390 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 GULP1-206ENST00000409830 1376 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ESR2-201ENST00000267525 1518 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 YTHDF1-202ENST00000370339 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SCART1-206ENST00000640237 4351 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 VASP-201ENST00000245932 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RHOC-201ENST00000285735 2199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 UAP1L1-202ENST00000409858 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 FALEC-201ENST00000416894 566 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 TPM4P1-201ENST00000436100 807 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SNHG7-203ENST00000436596 509 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 PENK-208ENST00000523051 772 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 MRPL49-203ENST00000526171 501 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 IL18BP-211ENST00000531053 853 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 AC135586.2-201ENST00000537262 567 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ZBP1-208ENST00000541799 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ZNF580-202ENST00000543039 1707 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 AC104581.1-203ENST00000640240 353 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 PRKAR2B-201ENST00000265717 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 ZNF764-202ENST00000395091 2970 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 PXK-204ENST00000383716 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 CALU-205ENST00000535011 3210 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 SASH3-201ENST00000356892 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 KCMF1-201ENST00000409785 7568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 TAX1BP1-201ENST00000265393 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
ATP6V0D1P61421 DENND1A-202ENST00000373620 3612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 H2BFM-201ENST00000355016 1882 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 LITAF-201ENST00000339430 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 INA-201ENST00000369849 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 CDK16-202ENST00000357227 3144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 HIST1H3D-201ENST00000356476 411 ntAPPRIS P1 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 CKLF-204ENST00000362093 412 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 MIR503HG-203ENST00000441492 649 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 AC019257.1-202ENST00000521498 445 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 AC092384.3-201ENST00000561980 531 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 H3F3B-208ENST00000589599 576 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 GIPC1-213ENST00000591349 1068 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 AC244517.5-205ENST00000623615 575 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 DMAC2-210ENST00000592922 1622 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 KCNMA1-251ENST00000639090 4319 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 HLA-A-201ENST00000376802 1334 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 CDC14C-201ENST00000428251 1719 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 SLCO5A1-203ENST00000524945 3725 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 R3HDML-201ENST00000217043 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 BMP4-201ENST00000245451 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 MARVELD3-204ENST00000565261 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
ATP6V0D1P61421 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 87.8 ms