Protein–RNA interactions for Protein: P59190

RAB15, Ras-related protein Rab-15, humanhuman

Predictions only

Length 212 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RAB15P59190 LY6G6C-201ENST00000375819 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FBXO44-205ENST00000376768 959 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC021744.1-201ENST00000518354 453 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 INO80E-210ENST00000567705 880 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RAB3D-202ENST00000589655 924 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC005498.2-205ENST00000593218 784 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NNAT-201ENST00000062104 1297 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 C16orf71-201ENST00000299320 2722 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CA10-203ENST00000451037 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GTPBP3-201ENST00000324894 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LAT-203ENST00000395456 1616 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ATP6V0E2-202ENST00000425642 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PFKL-201ENST00000349048 2912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 EPS15L1-207ENST00000594975 2489 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SNX17-210ENST00000537606 2400 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RDH13-202ENST00000396247 1987 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TCTN1-229ENST00000614115 1965 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 BCL2L11-201ENST00000308659 1522 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ST3GAL5-229ENST00000638986 2331 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MELTF-201ENST00000296350 3963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SIGLEC10-201ENST00000339313 2256 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PLEKHJ1-211ENST00000589097 2251 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AMOTL2-211ENST00000513145 2653 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 B3GNT3-201ENST00000318683 2226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ZNF687-201ENST00000324048 5378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SLC7A9-204ENST00000590341 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CACNA1A-215ENST00000635727 7536 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DNM1-202ENST00000372923 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 C6orf132-201ENST00000341865 6210 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TAPBP-238ENST00000475304 1686 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MRPL43-201ENST00000299179 747 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 S100A14-204ENST00000368702 1218 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 BAX-206ENST00000415969 540 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPDYE7P-202ENST00000420373 878 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SPCS2P4-201ENST00000436160 681 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 S100A14-206ENST00000476873 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 VASH2-211ENST00000517399 1068 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC064807.1-203ENST00000520357 575 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC069262.1-201ENST00000539058 672 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 FGFR1OP2-206ENST00000546072 956 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC009053.3-201ENST00000567148 574 ntTSL 4 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC244153.1-203ENST00000622796 419 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 OGG1-206ENST00000349503 1950 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TBC1D10B-201ENST00000409939 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 UGT3A2-204ENST00000513300 1924 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ANXA8-203ENST00000583874 1860 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CLDN7-201ENST00000360325 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CDIPT-209ENST00000569956 1532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ITGA3-202ENST00000320031 4888 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 HDAC8-206ENST00000373571 2133 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 COQ8B-202ENST00000324464 2443 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 STARD7-201ENST00000337288 3368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CNOT8-204ENST00000517876 2708 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CNPPD1-202ENST00000409789 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 SYNCRIP-202ENST00000369622 3023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ZNF618-203ENST00000374126 3018 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC016396.2-201ENST00000562575 1417 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC092068.3-201ENST00000587894 2016 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 ENOSF1-202ENST00000340116 1658 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 AC092384.3-202ENST00000564646 2873 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 LHFPL2-207ENST00000515007 4680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MOCS1-206ENST00000425303 1920 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 TMC3-AS1-203ENST00000559781 2195 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 DUS3L-201ENST00000309061 2113 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 CSNK1G2-AS1-201ENST00000314315 1252 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 VMA21-202ENST00000370361 693 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 PTMS-202ENST00000389462 773 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
RAB15P59190 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.3 ms