Protein–RNA interactions for Protein: P52888

THOP1, Thimet oligopeptidase, humanhuman

Predictions only

Length 689 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THOP1P52888 CU104787.1-201ENST00000624155 288 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 GPR176-205ENST00000561100 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ULBP2-201ENST00000367351 1349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PTPRC-206ENST00000413409 1338 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ADAMTS4-201ENST00000367995 1961 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PHRF1-201ENST00000264555 5523 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 KIAA2026-202ENST00000399933 6988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PRKCSH-217ENST00000592741 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 MFSD2B-202ENST00000406420 1528 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 STX3-203ENST00000529177 1571 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CERCAM-213ENST00000612334 1554 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TCP11L2-201ENST00000299045 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PRX-202ENST00000324001 4855 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 DLGAP1-220ENST00000581699 2258 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ATG5-210ENST00000636437 2261 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 IKBIP-201ENST00000299157 3189 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TPM1-205ENST00000357980 1800 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 SHMT2-232ENST00000557487 1918 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TMED7-TICAM2-201ENST00000282382 3491 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ANKRD26P3-201ENST00000454044 2748 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 NRN1L-201ENST00000339176 710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ID3-201ENST00000374561 1251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PMS2P4-201ENST00000412466 1052 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 FXYD6-209ENST00000530956 579 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 RNASEK-207ENST00000552842 595 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ZNF84-208ENST00000539354 3237 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CSNK2A1-203ENST00000400217 1451 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 DRC7-201ENST00000336825 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC068944.1-201ENST00000514855 1604 ntTSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 CDKN2AIP-203ENST00000504169 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 C12orf40-202ENST00000405531 1656 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ALDH3A1-205ENST00000444455 1771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
THOP1P52888 NFIC-211ENST00000641145 8399 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 TRIM39-205ENST00000396551 3249 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ALDH3B1-208ENST00000617288 2078 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 ANKRD23-203ENST00000418232 2156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 GTF2H1-203ENST00000453096 2707 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PPM1D-201ENST00000305921 4778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
THOP1P52888 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 MAPKAP1-202ENST00000350766 3256 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 PRICKLE1-211ENST00000639566 3341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 RELT-201ENST00000064780 3535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC092474.2-201ENST00000424288 719 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC243562.1-201ENST00000560672 389 ntBASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC133550.1-201ENST00000563565 295 ntTSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
THOP1P52888 YAP1-211ENST00000629586 1365 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.6 ms