Protein–RNA interactions for Protein: P48169

GABRA4, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-4, humanhuman

Predictions only

Length 554 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA4P48169 PPRC1-201ENST00000278070 5330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CROCCP1-201ENST00000426910 5675 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM101-201ENST00000206380 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PNKD-201ENST00000248451 758 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MUC1-201ENST00000337604 859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC091729.2-201ENST00000415656 302 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC009477.1-201ENST00000452936 217 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM63A-209ENST00000537914 1018 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MIR4745-201ENST00000577608 62 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RASSF5-205ENST00000581503 5586 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZBTB32-201ENST00000262630 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BCL2L2-PABPN1-203ENST00000557008 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BEND4-201ENST00000502486 8765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PARVG-205ENST00000422871 3462 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM39B-201ENST00000336294 1813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PIK3R2-201ENST00000222254 4033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PCDHA2-201ENST00000378132 2626 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 OCIAD1-202ENST00000381473 1594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 WT1-203ENST00000379079 2466 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ORMDL3-201ENST00000304046 2111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AUNIP-201ENST00000374298 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 IFT74-203ENST00000433700 2119 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SIRT1-201ENST00000212015 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C2orf48-201ENST00000381786 1897 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ZBTB44-201ENST00000357899 2781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 VIPR1-204ENST00000438259 2427 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C12orf66-204ENST00000544871 2441 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FOXA1-201ENST00000250448 2862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PHRF1-202ENST00000413872 5224 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 INPP5J-207ENST00000405300 2515 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NUP50-203ENST00000407019 2059 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BFSP1-205ENST00000536626 2075 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SPATS2L-218ENST00000451764 2250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RPS19-201ENST00000221975 500 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LRRC28-202ENST00000331450 752 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CALY-203ENST00000368558 825 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 XAGE1A-203ENST00000375602 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 XAGE1B-203ENST00000375616 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 COLEC11-205ENST00000402922 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RAC2-204ENST00000406508 893 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ERGIC1-212ENST00000523291 586 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RPS19-202ENST00000593863 526 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC026979.3-201ENST00000607315 403 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TSC22D4-201ENST00000300181 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ATXN7-210ENST00000487717 3683 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ALDOA-226ENST00000569798 1499 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 SACS-AS1-201ENST00000443092 2234 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NOS3-210ENST00000484524 2537 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PIEZO1-201ENST00000301015 8072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FAM210A-201ENST00000322247 4340 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CYP46A1-201ENST00000261835 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 CCT2-202ENST00000543146 2189 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 OSBPL1A-204ENST00000399443 3317 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 KLK10-202ENST00000358789 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 ATP5B-201ENST00000262030 1839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LANCL3-201ENST00000378619 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NRSN1-203ENST00000378478 2408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AP000487.1-202ENST00000500185 2602 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 TEX261-201ENST00000272438 3441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NUDT4P1-201ENST00000322209 1206 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC073349.1-201ENST00000340779 1062 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 FAM19A3-202ENST00000369630 1282 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HNRNPA3P1-201ENST00000401429 1139 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 C2orf76-202ENST00000409466 1150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC016735.2-201ENST00000438736 569 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 HNRNPA3P5-201ENST00000455201 833 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NECAP2-203ENST00000457722 935 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PKD2-202ENST00000502363 1222 ntTSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 BRK1-201ENST00000530758 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 AC009407.1-201ENST00000568958 598 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 PAM16-215ENST00000577031 548 ntTSL 4 BASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
GABRA4P48169 NOMO2-202ENST00000381474 3911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms