Protein–RNA interactions for Protein: P46100

ATRX, Transcriptional regulator ATRX, humanhuman

Predictions only

Length 2,492 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATRXP46100 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 MPDU1-223ENST00000582151 728 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 SLC16A13-201ENST00000308027 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 USP48-204ENST00000400301 4309 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FLOT2-202ENST00000394908 2618 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 KRT8P49-201ENST00000604166 1432 ntBASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ADGRB1-201ENST00000323289 5527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 LRRC38-201ENST00000376085 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ETV7-207ENST00000620358 1599 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 ZDHHC4-204ENST00000396709 1485 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 BCAS4-201ENST00000358791 1378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.04
ATRXP46100 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FST-202ENST00000396947 2538 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NPY-201ENST00000242152 585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MRPL55-202ENST00000336300 722 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC017104.1-201ENST00000415129 720 ntTSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL590093.1-201ENST00000416119 623 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FGF13-204ENST00000436198 1165 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DMKN-216ENST00000458071 510 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CTBP2P4-201ENST00000513884 920 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC139099.3-201ENST00000572850 472 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC011472.1-201ENST00000588634 569 ntTSL 4 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC136475.1-202ENST00000602429 1151 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP001505.2-201ENST00000616815 443 ntBASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C9orf50-202ENST00000619117 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LINC01672-205ENST00000635092 633 ntTSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NR2F1-201ENST00000327111 3732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SKOR1-203ENST00000554054 3620 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CCDC17-202ENST00000421127 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MSC-AS1-208ENST00000522519 1537 ntTSL 2 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NOX4-201ENST00000263317 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FAM72C-202ENST00000584486 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RDH12-201ENST00000267502 1833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BEND4-202ENST00000504360 8692 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 APEH-202ENST00000438011 2249 ntTSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PPP1R18-205ENST00000615527 4597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AATK-203ENST00000417379 5081 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.77□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TUBG2-201ENST00000251412 1761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DNLZ-202ENST00000371739 2934 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 APOA1-204ENST00000375323 1088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PFN2-202ENST00000423691 911 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 OLR1-203ENST00000432556 950 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC008406.2-201ENST00000507058 532 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C8orf88-201ENST00000517562 894 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IGHV3OR16-9-202ENST00000558425 288 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SREBF2-209ENST00000612482 5365 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 B4GALNT2-201ENST00000300404 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LRCH4-201ENST00000310300 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 KRT84-201ENST00000257951 2092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NDUFS2-202ENST00000392179 2064 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TNK2-AS1-201ENST00000458180 2096 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 BEGAIN-202ENST00000443071 2744 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MAML1-201ENST00000292599 5723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 MAFF-207ENST00000538999 2365 ntTSL 2 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TM9SF1-206ENST00000528669 2425 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PHF2-202ENST00000375376 3045 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NBEA-201ENST00000310336 10794 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 NBEA-208ENST00000629018 10791 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC25A24-204ENST00000569674 2357 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC138028.4-201ENST00000564984 1845 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HDAC10-202ENST00000349505 1950 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TREM2-203ENST00000373122 1012 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LARGE-AS1-202ENST00000424291 1065 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TPO-215ENST00000539820 1157 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC036164.1-201ENST00000570544 333 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 LINC00237-203ENST00000593272 630 ntTSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 PARP6-220ENST00000569795 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 TCERG1L-201ENST00000368642 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 HPN-202ENST00000392226 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF133-212ENST00000622607 2660 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IDH3G-204ENST00000427365 1526 ntTSL 5 BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF696-201ENST00000330143 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IL17RC-206ENST00000416074 2342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.76□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SLC22A12-201ENST00000336464 1854 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 EVX1-202ENST00000496902 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 GGT6-203ENST00000573591 1730 ntTSL 4 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ZNF274-203ENST00000424679 2539 ntTSL 1 (best) BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 IL2RG-202ENST00000374188 1432 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC097065.1-201ENST00000425737 517 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 DDX39AP1-201ENST00000445147 1181 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 SNHG17-208ENST00000456953 546 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 AL022344.2-201ENST00000568976 968 ntBASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 C19orf70-206ENST00000590389 769 ntTSL 3 BASIC14.75□□□□□ -0.05
ATRXP46100 ETV2-207ENST00000619399 994 ntTSL 5 BASIC14.75□□□□□ -0.05
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