Protein–RNA interactions for Protein: P42338

PIK3CB, Phosphatidylinositol 4,5-bisphosphate 3-kinase catalytic subunit beta isoform, humanhuman

Predictions only

Length 1,070 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PIK3CBP42338 BICD2-201ENST00000356884 6427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TMEM132D-202ENST00000422113 5776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC022188.1-201ENST00000620960 1664 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HYMAI-201ENST00000635591 3347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MYCL-203ENST00000397332 3256 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ELK1-202ENST00000343894 736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ZGLP1-201ENST00000403352 1028 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SAPCD1-209ENST00000425424 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HIST4H4-204ENST00000539745 577 ntAPPRIS P1 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FAM177A1-207ENST00000554052 540 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 F10-202ENST00000375559 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FBP1-201ENST00000375326 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 EIF4ENIF1-206ENST00000397525 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MITF-204ENST00000352241 4814 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CYP11A1-201ENST00000268053 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 MYB-242ENST00000618728 3545 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 RASAL3-201ENST00000343625 3293 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 WAC-203ENST00000354911 3042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC007950.2-201ENST00000615045 2347 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KL-201ENST00000380099 5006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 GNRHR2-201ENST00000312753 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HMBS-209ENST00000537841 1559 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KDM4B-203ENST00000536461 5027 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PSMC3-201ENST00000298852 1544 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HSD17B6-203ENST00000554150 1547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 APH1A-204ENST00000414276 1718 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CCDC8-201ENST00000307522 3213 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PRDM8-201ENST00000339711 4095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 HSPB1-201ENST00000248553 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SNHG11-205ENST00000421599 1046 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC093724.1-201ENST00000448659 1027 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NECAP2-208ENST00000504551 768 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PAX9-204ENST00000554201 1289 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 QPRT-203ENST00000562473 579 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 AC016027.1-202ENST00000607927 1699 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PPP1R26-205ENST00000605286 4744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NUS1-201ENST00000368494 4676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CBX8-201ENST00000269385 3791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 DDOST-206ENST00000602624 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 STUM-201ENST00000366788 7705 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLFNL1-203ENST00000372611 1865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PIK3CBP42338 CAMKV-204ENST00000466940 1475 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 40.6 ms