Protein–RNA interactions for Protein: P42166

TMPO, Lamina-associated polypeptide 2, isoform alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 694 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPOP42166 LDB3-208ENST00000623007 1664 ntTSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 NR2C1-201ENST00000330677 2014 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 AC124067.4-201ENST00000519691 2379 ntBASIC21.28■■□□□ 1
TMPOP42166 RASIP1-201ENST00000222145 3308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 MYB-205ENST00000367814 3302 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 EXD3-203ENST00000465160 1585 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 CIAPIN1-207ENST00000565961 1814 ntTSL 3 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 ARHGAP22-201ENST00000249601 2751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 CDC14A-202ENST00000361544 2417 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 IL11RA-215ENST00000602473 1388 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 TXNDC11-202ENST00000356957 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 SREBF2-201ENST00000361204 5240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 HSPA1A-201ENST00000375651 2483 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 XKR4-203ENST00000622811 3907 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 RPL36-201ENST00000347512 707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 IGHV3-23-201ENST00000390609 432 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 MUSTN1-201ENST00000446157 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 SHF-202ENST00000458022 1163 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 USP27X-201ENST00000621775 2618 ntAPPRIS P1 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 TRAF3-204ENST00000539721 1786 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 IL11-201ENST00000264563 2281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 CBSL-201ENST00000398168 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 PELI3-209ENST00000618547 2508 ntTSL 2 BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
TMPOP42166 ADAMTS17-201ENST00000268070 6207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MKRN3-203ENST00000568252 1312 ntTSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TEF-201ENST00000266304 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FRMD6-AS1-201ENST00000617151 2229 ntBASIC21.27■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TTLL11-201ENST00000321582 3250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CYP2T1P-202ENST00000641596 2535 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TOM1L1-204ENST00000570371 2442 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 NAIF1-201ENST00000373078 3399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZC3H12D-202ENST00000409948 753 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL139010.1-201ENST00000454878 894 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CD28-203ENST00000458610 705 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TMEM120B-206ENST00000540377 962 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC005523.1-201ENST00000598782 418 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ASAH1-254ENST00000637636 2218 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL691432.1-201ENST00000596308 1422 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TSPEAR-202ENST00000397916 2114 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC006064.2-201ENST00000501075 2196 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 APBA2-207ENST00000558402 4031 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 C1QTNF6-202ENST00000397110 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CCDC90B-203ENST00000525503 1919 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZYG11A-202ENST00000371532 3942 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SLC39A1-202ENST00000356205 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 C14orf93-202ENST00000341470 2221 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ATP6AP2-215ENST00000636409 1962 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 N4BP3-201ENST00000274605 6080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MOV10L1-201ENST00000262794 3960 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 APBB1-202ENST00000311051 2619 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PCBP4-202ENST00000355852 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 GPAT2-201ENST00000359548 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 C6orf99-202ENST00000367073 769 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 BEND5-201ENST00000371833 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AL162231.3-201ENST00000556278 902 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 COMMD4-207ENST00000562789 746 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CLN3-246ENST00000636228 1224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TUBB3-201ENST00000315491 1769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FHL2-205ENST00000393353 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 FAM227B-201ENST00000299338 2008 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 TMEM220-202ENST00000455996 1402 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 PTOV1-219ENST00000601638 1413 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 DBNDD2-205ENST00000372717 1207 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
TMPOP42166 SPDYE17-201ENST00000412399 783 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 46.8 ms