Protein–RNA interactions for Protein: P40616

ARL1, ADP-ribosylation factor-like protein 1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 181 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ARL1P40616 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SCUBE1-202ENST00000360835 9808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL1P40616 GUCA1A-203ENST00000394237 2233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SH2B1-206ENST00000545570 1488 ntTSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL1P40616 RSBN1-201ENST00000261441 6621 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.29■□□□□ 0.2
ARL1P40616 ZNF425-201ENST00000378061 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TAF1B-201ENST00000263663 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TSPAN5-201ENST00000305798 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 KRT35-202ENST00000393989 1670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TSKU-205ENST00000612930 2666 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AC105760.2-201ENST00000418430 2341 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CCDC40-201ENST00000269318 1970 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CTSD-213ENST00000637915 1982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 JARID2-201ENST00000341776 5755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 STX10-201ENST00000242770 1099 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AP4S1-202ENST00000313566 839 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 GYG2P1-204ENST00000382966 639 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 ODF3B-202ENST00000401779 869 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 ODF3B-203ENST00000403326 643 ntTSL 3 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 DUSP6-204ENST00000547291 1074 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 STX10-204ENST00000587230 1136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AC010776.2-201ENST00000588946 1081 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 KIAA0319-203ENST00000535378 6896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 FERMT1-201ENST00000217289 5151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 KLC4-202ENST00000347162 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 LRFN2-201ENST00000338305 3270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TRIM27-202ENST00000377199 2967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CHAD-201ENST00000258969 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 ATG9A-205ENST00000409618 4025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.28■□□□□ 0.2
ARL1P40616 CCNY-201ENST00000265375 4768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 UHRF1BP1-202ENST00000452449 4706 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 PODNL1-201ENST00000254320 1859 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 PAX6-203ENST00000379109 3182 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 LATS1-207ENST00000543571 7517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 DAP-201ENST00000230895 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 HYAL1-202ENST00000320295 2324 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 ZNF618-207ENST00000615615 9289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 EHD4-201ENST00000220325 6416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TMEM14A-201ENST00000211314 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 RSPH14-201ENST00000216036 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 FAM99B-201ENST00000382166 1067 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 C7orf34-201ENST00000409607 766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 MYCNOS-201ENST00000419083 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AC136632.2-201ENST00000512891 861 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TSPAN4-214ENST00000525201 834 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TOLLIP-AS1-201ENST00000530897 939 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AC012615.3-201ENST00000592884 500 ntTSL 3 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 GGTLC5P-201ENST00000617623 998 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 HIST1H2AK-201ENST00000618958 393 ntAPPRIS P1 BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AP001350.2-201ENST00000625104 1094 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 LINC00554-201ENST00000564841 3011 ntBASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.2
ARL1P40616 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 C6orf106-203ENST00000374026 4232 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PDGFB-201ENST00000331163 3497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ZNF672-201ENST00000306562 2989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SCP2-204ENST00000407246 2239 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SLC17A7-204ENST00000600601 2237 ntTSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 UCKL1-203ENST00000369908 1954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 ME2P1-201ENST00000426028 1970 ntBASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 DENND1B-211ENST00000620048 8378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 RUSC1-201ENST00000292254 2163 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PPM1A-203ENST00000395076 8184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 FSTL3-206ENST00000592947 2144 ntTSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.27■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CCNA2-201ENST00000274026 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 APOLD1-201ENST00000326765 4724 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 IRAK1-204ENST00000393687 2049 ntTSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 AP001781.3-201ENST00000622211 2939 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TMEM216-201ENST00000334888 1306 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 BICD1-205ENST00000550207 1328 ntTSL 3 BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 KHK-202ENST00000260599 2411 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.26■□□□□ 0.19
ARL1P40616 TLE2-202ENST00000426948 2406 ntTSL 5 BASIC16.26■□□□□ 0.19
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.2 ms