Protein–RNA interactions for Protein: P35658

NUP214, Nuclear pore complex protein Nup214, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,090 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NUP214P35658 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LCMT2-202ENST00000567039 1545 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CTSG-201ENST00000216336 886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NPB-201ENST00000333383 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SYS1-202ENST00000372727 813 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NDUFB2-209ENST00000472695 503 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CFL1-202ENST00000524553 860 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 YPEL3-209ENST00000566595 796 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC020765.3-201ENST00000613051 740 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LINC02167-203ENST00000566900 1489 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DNM1-201ENST00000341179 3254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TPST2-201ENST00000338754 5697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CACFD1-207ENST00000542192 2754 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 EPB41L4A-AS1-201ENST00000413221 2969 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 REPS2-201ENST00000303843 7771 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SH2B1-202ENST00000337120 6043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TMEM89-201ENST00000330862 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ISG15-203ENST00000624697 788 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZNF302-207ENST00000505365 2955 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BSCL2-210ENST00000421906 1440 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AKAP1-202ENST00000337714 3970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GPR89B-201ENST00000314163 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LRFN1-201ENST00000248668 3381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC073347.1-201ENST00000421633 2643 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 NDRG2-211ENST00000397858 2054 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 EPN2-201ENST00000314728 4871 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AARSD1-202ENST00000427569 1322 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IMPDH1-202ENST00000348127 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GUK1-202ENST00000366716 940 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 FAAHP1-202ENST00000446499 1238 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPL13AP23-201ENST00000480739 586 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CCND3-213ENST00000510503 1257 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PP7080-204ENST00000510714 601 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 LEPROTL1-203ENST00000518001 589 ntTSL 4 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ANAPC11-210ENST00000574924 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
NUP214P35658 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 IL1RN-202ENST00000354115 1747 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SHANK1-202ENST00000359082 6459 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ZNF628-203ENST00000598519 3847 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CHMP1A-201ENST00000397901 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TRIM46-211ENST00000611379 3082 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PDE9A-205ENST00000349112 1616 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GLIPR2-205ENST00000619700 1645 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CRYZL1-202ENST00000361534 2224 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TMC4-210ENST00000619895 2373 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 MAPKAPK3-203ENST00000446044 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TVP23C-210ENST00000584811 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SYT3-201ENST00000338916 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SLC4A1APP2-201ENST00000424054 1259 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AP000688.4-201ENST00000436303 446 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AC012363.1-201ENST00000455707 575 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 SUMO2P17-202ENST00000508743 738 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 CNOT8-225ENST00000524105 904 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RPS6KB1-203ENST00000406116 1982 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 AP000253.1-201ENST00000449339 2233 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
NUP214P35658 RRM2B-201ENST00000251810 4931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 ZNF114-204ENST00000595607 2478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 FADS1-216ENST00000542506 1725 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 MIEF1-202ENST00000402881 2269 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
NUP214P35658 MLKL-202ENST00000308807 2523 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 YY1AP1-211ENST00000368340 2927 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 CES1-202ENST00000361503 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 TRIM13-204ENST00000420995 2607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 KRTAP1-1-201ENST00000306271 903 ntAPPRIS P1 BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
NUP214P35658 TSPY3-202ENST00000440483 414 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 68.5 ms