Protein–RNA interactions for Protein: P32243

OTX2, Homeobox protein OTX2, humanhuman

Predictions only

Length 289 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
OTX2P32243 CRTC1-201ENST00000321949 2501 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KIAA0368-201ENST00000259335 7391 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 DNAJC7-201ENST00000316603 1468 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC012313.1-201ENST00000593393 3059 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 CEP83-AS1-201ENST00000623122 2482 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ZNF394-201ENST00000337673 2179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PON2-201ENST00000222572 1745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 IRF3-217ENST00000597198 1741 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 C1orf115-201ENST00000294889 3413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TOM1L2-209ENST00000540946 1420 ntTSL 2 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 MLLT10-203ENST00000377072 5126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 C10orf35-201ENST00000373279 1065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 UFL1-AS1-201ENST00000430796 548 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL158198.1-201ENST00000449143 380 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AC135586.1-201ENST00000539323 574 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 DBI-212ENST00000627305 620 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PDLIM3-213ENST00000629667 1016 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 AL358472.5-202ENST00000641448 1267 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 WAC-202ENST00000347934 2839 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 DGKE-204ENST00000572810 1843 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 KLC1-202ENST00000334553 2524 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PDPK2P-201ENST00000382326 2387 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 BANP-223ENST00000538234 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 TMEM161A-206ENST00000587583 1654 ntTSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PELP1-208ENST00000572293 5272 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 ACSL3-201ENST00000357430 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
OTX2P32243 IGSF8-201ENST00000314485 2343 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GTPBP8-202ENST00000383677 1787 ntTSL 3 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SQOR-208ENST00000568606 1792 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AP001094.4-201ENST00000579008 2176 ntBASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 KMT5C-212ENST00000630497 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 COL18A1-203ENST00000359759 6586 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LBX2-AS1-201ENST00000548978 1852 ntTSL 3 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 QSOX1-201ENST00000367600 2519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZNF74-201ENST00000357502 2788 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TSC2-207ENST00000439673 5287 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CFC1B-202ENST00000619050 1554 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 P4HA2-201ENST00000166534 2230 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TMEM51-202ENST00000376014 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ADORA2A-213ENST00000610595 2736 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CGRRF1-201ENST00000216420 2057 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AIFM3-201ENST00000399163 2309 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CPSF4-201ENST00000292476 1691 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 IL4I1-204ENST00000595948 2407 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NBL1-201ENST00000289749 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SELENOM-201ENST00000400299 694 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FBLN7-204ENST00000409667 1124 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SPTLC1P1-201ENST00000447199 261 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HLA-J-202ENST00000469281 1241 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CDK4-206ENST00000549606 558 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MAP4K2-202ENST00000377350 2931 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AGBL5-202ENST00000360131 3177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RHBG-204ENST00000537040 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC079922.2-201ENST00000457336 2022 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GPBAR1-204ENST00000522678 2003 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TSC22D3-203ENST00000372383 2266 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 TNIP1-211ENST00000521591 2274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 GLMP-201ENST00000362007 1604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SPDEF-201ENST00000374037 1895 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MPL-202ENST00000413998 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 WIF1-201ENST00000286574 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 CTSB-232ENST00000534510 1989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ACSM2B-211ENST00000567001 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DVL2-201ENST00000005340 3018 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AVPR1B-201ENST00000367126 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 DCST1-202ENST00000368419 2207 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 AC105020.1-201ENST00000435356 2205 ntBASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 MMP9-201ENST00000372330 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 HCST-201ENST00000246551 613 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 SNURF-201ENST00000338327 331 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PDSS2-201ENST00000369031 1236 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
OTX2P32243 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.5 ms