Protein–RNA interactions for Protein: P30049

ATP5D, ATP synthase subunit delta, mitochondrial, humanhuman

Predictions only

Length 168 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATP5DP30049 NXNL2-205ENST00000618633 739 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL589182.2-201ENST00000619332 1049 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NR4A3-201ENST00000330847 4982 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NCF1C-201ENST00000438382 1427 ntBASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CDCA5-201ENST00000275517 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 P3H1-202ENST00000296388 2585 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MRI1-202ENST00000319545 3027 ntTSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AGPAT1-202ENST00000375104 2017 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC25A48-203ENST00000425402 2062 ntTSL 5 BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 FAF1-202ENST00000396153 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 BMP7-201ENST00000395863 4013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.92■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 KCP-208ENST00000620378 4515 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CUX1-211ENST00000546411 4212 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CACFD1-206ENST00000540581 2880 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ASAH1-223ENST00000636171 2283 ntTSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 HNRNPRP1-201ENST00000453465 1695 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NBEA-203ENST00000379939 10738 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DYRK3-201ENST00000367106 2329 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PLAA-205ENST00000520884 2041 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 C10orf111-201ENST00000624760 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 C21orf2-201ENST00000325223 1283 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL512785.2-202ENST00000367932 830 ntTSL 4 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LINC00421-201ENST00000413833 1054 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LINC00982-205ENST00000420957 435 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LAT-205ENST00000454369 1262 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 UNC93B7-201ENST00000509439 705 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AF238378.1-201ENST00000526806 358 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TMEM258-204ENST00000537328 575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SART3-203ENST00000546611 1184 ntBASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TMEM220-203ENST00000578345 559 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PLAUR-214ENST00000601723 1205 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL161669.4-201ENST00000634353 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ADAMTS14-202ENST00000373208 5269 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TMEM155-202ENST00000394394 1753 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CEP170B-203ENST00000453495 6813 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RASA4B-202ENST00000465829 2931 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC3A2-208ENST00000536981 1486 ntTSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 UBE2J1-201ENST00000435041 4290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 IBA57-201ENST00000366711 7817 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PTHLH-202ENST00000395868 1674 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RAD1-208ENST00000628399 1678 ntTSL 3 BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MARK4-202ENST00000300843 5209 ntTSL 1 (best) BASIC16.91■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PNMA6E-202ENST00000633844 2596 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RUNX1-202ENST00000344691 7274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NPAS2-201ENST00000335681 4007 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TIMP3-201ENST00000266085 4603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SLC2A13-202ENST00000380858 3082 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 CREM-211ENST00000374726 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 FAM3A-205ENST00000393572 1041 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 UPK3A-202ENST00000396082 627 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 KRTAP5-11-201ENST00000398530 1021 ntAPPRIS P2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL109741.1-201ENST00000432195 403 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL137026.1-202ENST00000452578 1089 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SELENOS-203ENST00000526049 1188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ZSCAN1-203ENST00000601162 813 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AL353135.1-201ENST00000606729 504 ntBASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RCAN3-210ENST00000618490 2386 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PDXK-202ENST00000327574 2583 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ABLIM2-201ENST00000341937 2589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 EED-202ENST00000327320 2033 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 IPPK-201ENST00000287996 4401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RGR-202ENST00000359452 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 ATP2A3-206ENST00000397043 3197 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 NTRK2-202ENST00000304053 8226 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DNAJC21-202ENST00000382021 6208 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 HLA-B-249ENST00000412585 1547 ntAPPRIS P1 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 HTD2-201ENST00000461393 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 DACT3-203ENST00000410105 3085 ntTSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 LHCGR-203ENST00000403273 1921 ntTSL 5 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 RCC2-202ENST00000375436 4087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
ATP5DP30049 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.9■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.7 ms