Protein–RNA interactions for Protein: P28074

PSMB5, Proteasome subunit beta type-5, humanhuman

Predictions only

Length 263 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PSMB5P28074 OAZ2-207ENST00000560258 1744 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PCDHA13-202ENST00000409494 4884 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CDS1-201ENST00000295887 4461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IFT140-203ENST00000426508 5270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CD300LG-204ENST00000539718 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AFTPH-202ENST00000238856 4040 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DDOST-202ENST00000415136 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 COL23A1-202ENST00000407622 2329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PDS5A-201ENST00000303538 7176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GPRC5C-201ENST00000342648 1273 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SPDYE14P-201ENST00000442619 822 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RPS27L-204ENST00000455271 923 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC092183.1-201ENST00000469884 875 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ALG1L8P-201ENST00000533887 760 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC012617.1-203ENST00000590845 439 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C5orf24-202ENST00000394976 5065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RFWD2-204ENST00000367669 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GSAP-201ENST00000257626 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PHKG1-205ENST00000452681 2226 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MCM3AP-AS1-202ENST00000420074 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SLC4A5-203ENST00000377632 3123 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SSH3-201ENST00000308127 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PGR-209ENST00000617858 2816 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LINC00094-205ENST00000603928 5722 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC006449.6-201ENST00000612330 2296 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 KCNT1-202ENST00000371757 4717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TAP2-202ENST00000374899 2497 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RTEL1-TNFRSF6B-202ENST00000482936 4931 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TMEM176A-202ENST00000461345 635 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SMIM15-AS1-201ENST00000506902 796 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RNA5SP410-201ENST00000516285 106 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC131009.1-201ENST00000539078 426 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC020558.1-201ENST00000583662 425 ntTSL 3 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TBC1D3D-201ENST00000616101 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TBC1D3K-201ENST00000620247 2116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SLC8A3-202ENST00000356921 5250 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 ZFP3-201ENST00000318833 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 VCAN-204ENST00000502527 2087 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NSUN5-202ENST00000310326 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 CTSB-201ENST00000345125 2028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 MYO3A-206ENST00000543632 2203 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IQCE-217ENST00000623361 6775 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AP3S2-216ENST00000617003 1561 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 DIP2A-205ENST00000466639 2711 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 YARS2-201ENST00000324868 2122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SIGLEC10-205ENST00000439889 2126 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SNED1-202ENST00000342631 1930 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 SLC22A1-202ENST00000366963 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 PRR18-201ENST00000322583 3084 ntAPPRIS P2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 NFIC-203ENST00000443272 1716 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 KRT18P28-201ENST00000453838 1332 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PSMB5P28074 AC004233.2-201ENST00000573315 2062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 80.7 ms