Protein–RNA interactions for Protein: P28067

HLA-DMA, HLA class II histocompatibility antigen, DM alpha chain, humanhuman

Predictions only

Length 261 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HLA-DMAP28067 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BX276092.9-202ENST00000636096 1722 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CCDC74B-202ENST00000392984 1353 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 UBXN2B-201ENST00000399598 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GRIN3A-201ENST00000361820 7770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ARVCF-201ENST00000263207 4041 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TRAPPC3-209ENST00000616395 1336 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ARFGAP2-202ENST00000426335 2937 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 KLK12-201ENST00000250351 882 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 NUDT8-201ENST00000301490 809 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BAALC-202ENST00000306391 243 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 KLK12-202ENST00000319590 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BAALC-204ENST00000330955 222 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ROMO1-204ENST00000374078 498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 C1QC-203ENST00000374640 1163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ISG15-201ENST00000379389 711 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CAMTA1-IT1-201ENST00000427317 365 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC073343.2-202ENST00000430844 532 ntTSL 4 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GCFC2-207ENST00000470503 1066 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 APBB3-216ENST00000511201 1014 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DUX4L17-201ENST00000557360 1267 ntBASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GOLGA2P7-203ENST00000557881 896 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LCE1E-203ENST00000619588 267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RAB34-226ENST00000636772 1180 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MANSC1-201ENST00000396349 2220 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HS2ST1-202ENST00000370551 1585 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PARVB-203ENST00000404989 1591 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PARVB-204ENST00000406477 1569 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PRMT2-208ENST00000451211 1878 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SDK1-210ENST00000615806 10258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 EP400-203ENST00000333577 3092 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ZNF135-202ENST00000359978 2120 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SYT1-201ENST00000261205 4808 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HARS-203ENST00000431330 1774 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 STRA6-207ENST00000535552 2631 ntTSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PIK3CD-206ENST00000536656 5483 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PIK3CD-208ENST00000628140 5483 ntTSL 5 BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CCHCR1-208ENST00000451521 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CEACAM21-203ENST00000407170 1691 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CSF3-206ENST00000577675 1360 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AKR1A1-214ENST00000621846 1360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ADAM23-202ENST00000374415 2714 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CCDC144B-202ENST00000445752 2197 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 COL5A1-208ENST00000618395 8437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RUBCNL-204ENST00000378797 3206 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 RPS12-201ENST00000230050 631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 IFI6-201ENST00000339145 822 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TSPO2-202ENST00000373161 958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 COL11A2-204ENST00000395194 1194 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LBX1-AS1-203ENST00000454527 740 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LBX1-AS1-204ENST00000456391 421 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TSPO2-203ENST00000470917 699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC103957.2-201ENST00000521218 510 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LY6E-214ENST00000522971 857 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC087623.2-201ENST00000528407 534 ntTSL 4 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 DUT-205ENST00000558813 769 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 AC005336.2-201ENST00000593183 939 ntBASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CYB561D2-210ENST00000607121 1004 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PDCD5-203ENST00000419343 1799 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CLPTM1L-216ENST00000630539 2032 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ELN-208ENST00000380575 3043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 EIF4G1-203ENST00000350481 4990 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PER1-201ENST00000317276 4707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 HAPLN3-201ENST00000359595 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MAP2K5-202ENST00000340972 1491 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 PTPRO-202ENST00000348962 5061 ntTSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CRADD-202ENST00000542893 1403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 LINC00639-201ENST00000553932 4496 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MIER1-208ENST00000401041 2552 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 TOM1-209ENST00000447733 2317 ntTSL 2 BASIC14.23□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.22□□□□□ -0.13
HLA-DMAP28067 CTBP1-AS2-205ENST00000578730 2757 ntTSL 2 BASIC14.22□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.7 ms