Protein–RNA interactions for Protein: P26022

PTX3, Pentraxin-related protein PTX3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 381 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTX3P26022 MRPS16-201ENST00000372940 866 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GRM5-203ENST00000393294 1268 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 LINC00237-202ENST00000455890 1220 ntTSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SMCO4-204ENST00000527149 472 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BEAN1-203ENST00000561796 1078 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC008878.2-201ENST00000601870 942 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SBK3-202ENST00000612221 1270 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL513190.1-201ENST00000621254 727 ntBASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RNF31-201ENST00000324103 3627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NEO1-207ENST00000560262 4315 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SMIM13-202ENST00000416247 4688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RWDD4-201ENST00000326397 2641 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MYB-203ENST00000341911 3672 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 NR4A2-210ENST00000429376 1571 ntTSL 5 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SIPA1-201ENST00000394224 3628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DAND5-202ENST00000585548 1731 ntTSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 BIRC7-201ENST00000217169 1368 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SIRT6-214ENST00000601488 1361 ntTSL 3 BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HHATL-205ENST00000441594 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.74■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRKN-202ENST00000366892 1505 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL592424.1-201ENST00000563624 1536 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLC4A3-201ENST00000273063 4246 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRPF31-201ENST00000321030 2126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GNG2-213ENST00000556766 2125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 EIF2B4-206ENST00000451130 1633 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CEP72-201ENST00000264935 2434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MYEF2-215ENST00000610570 2591 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KRTCAP2-201ENST00000295682 552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RNF151-201ENST00000321392 786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 VSTM1-201ENST00000338372 1023 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 Metazoa_SRP.28-201ENST00000366402 260 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TCEAL3-203ENST00000372628 1221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SMIM27-204ENST00000453396 1003 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AL807752.7-201ENST00000471521 989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC139887.2-202ENST00000507446 534 ntTSL 4 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC112191.1-201ENST00000523689 701 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 KRTAP5-9-201ENST00000528743 1136 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RNF151-203ENST00000569714 796 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP002472.1-201ENST00000577490 586 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC092865.6-201ENST00000642101 219 ntBASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CCDC83-201ENST00000280245 2358 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 EYA2-208ENST00000497062 2384 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC053503.2-201ENST00000420563 1598 ntTSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DNAAF2-202ENST00000406043 2819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DNM2-202ENST00000359692 3588 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CCDC127-201ENST00000296824 9342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 RALYL-208ENST00000522455 2168 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GNE-202ENST00000396594 5298 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRMT6-201ENST00000370078 2616 ntAPPRIS P1 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CNPY4-201ENST00000262932 1502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TUSC3-204ENST00000506802 1546 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SP100-205ENST00000409824 1802 ntTSL 5 BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ARHGAP27-208ENST00000528384 2296 ntTSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 REPS1-201ENST00000258062 3161 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.73■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP000787.1-201ENST00000501356 1926 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP001122.1-202ENST00000501648 1916 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC092919.2-201ENST00000623631 1645 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 MAP3K3-202ENST00000361733 3529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 PRRT4-201ENST00000446477 3544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 LINC00599-203ENST00000519461 2922 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 GPER1-202ENST00000397088 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ACAT2-201ENST00000367048 3180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SYTL2-215ENST00000527523 3049 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TACR2-202ENST00000373307 1740 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SLIT3-201ENST00000332966 4895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 LINC01118-203ENST00000479311 1588 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 WASH6P-202ENST00000359512 1437 ntBASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 EWSR1-201ENST00000331029 2267 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 HMGN4-201ENST00000377575 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DANCR-201ENST00000411630 904 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AP000355.1-201ENST00000432032 480 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 FOSB-211ENST00000592436 1057 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 AC247036.6-201ENST00000632950 410 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 C9orf172-201ENST00000436881 4387 ntAPPRIS P1 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 SGSH-201ENST00000326317 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 LYPD5-203ENST00000594013 1519 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.72■□□□□ 0.11
PTX3P26022 DNM2-203ENST00000389253 3581 ntTSL 5 BASIC15.72■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 62.6 ms