Protein–RNA interactions for Protein: P25774

CTSS, Cathepsin S, humanhuman

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Length 331 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTSSP25774 KDM6A-213ENST00000611820 5924 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC092143.3-201ENST00000565150 1900 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TIGAR-201ENST00000179259 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 IQCC-202ENST00000537469 2252 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PANK2-209ENST00000621507 1763 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC073439.1-201ENST00000624121 1774 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 C1orf43-203ENST00000368516 872 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MRPL28-202ENST00000389675 865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TSPY16P-201ENST00000449843 468 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 COX20P2-201ENST00000452636 358 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SNX21-206ENST00000462307 1043 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 IFT20-215ENST00000585313 852 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MRPL34-202ENST00000594999 555 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF697-201ENST00000421812 5041 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 WNK1-206ENST00000535572 9886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CLDN14-201ENST00000342108 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AP2A2-222ENST00000534328 1491 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DYRK1B-205ENST00000597639 1806 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TCP10L2-202ENST00000366832 2185 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GUCY1B3-206ENST00000507146 2709 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 C10orf107-201ENST00000330194 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DNAJA3-201ENST00000262375 2763 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LIPE-AS1-201ENST00000457234 1501 ntTSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 F7-201ENST00000346342 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SRF-201ENST00000265354 4202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GCK-209ENST00000616242 2260 ntTSL 5 BASIC14.61□□□□□ -0.07
CTSSP25774 POTEE-204ENST00000613282 1926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 POTEI-202ENST00000615053 1926 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RAN-212ENST00000543796 2661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LY6K-205ENST00000522591 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CBX6-202ENST00000407418 6122 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DNAAF1-201ENST00000378553 2379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DKC1-201ENST00000369550 2577 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PPP3CA-201ENST00000323055 4519 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FDX1-201ENST00000260270 3206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM41A-201ENST00000296254 1060 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FKBP2-201ENST00000309366 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CKS1B-202ENST00000368436 820 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL365255.1-202ENST00000413887 363 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 LINC01983-203ENST00000444346 519 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMEM176B-205ENST00000450753 1006 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PTPRVP-202ENST00000490575 953 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TATDN3-212ENST00000530441 492 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GABARAP-205ENST00000573928 476 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC016168.1-201ENST00000591422 722 ntTSL 3 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SNHG8-201ENST00000602414 672 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SNHG8-205ENST00000602819 470 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC073592.8-201ENST00000624126 511 ntBASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FHL2-201ENST00000322142 1462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NBL1-211ENST00000618761 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SYTL3-203ENST00000367081 2692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CDH23-205ENST00000398809 4533 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC104809.1-201ENST00000425110 2345 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FOXN1-203ENST00000579795 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 GPS1-202ENST00000320548 1949 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KIF16B-201ENST00000354981 5261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC8A3-203ENST00000357887 5259 ntTSL 5 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC8A3-204ENST00000381269 5268 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AC136759.1-201ENST00000534201 2163 ntTSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FUT2-201ENST00000391876 1593 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 RNF103-201ENST00000237455 3477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 PPP1R3E-201ENST00000452015 4773 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.6□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL513523.2-202ENST00000427283 2040 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ABLIM2-202ENST00000361581 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 FHL1-207ENST00000394155 2706 ntTSL 5 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 AL031731.1-201ENST00000642131 2094 ntBASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 CHID1-215ENST00000528581 1431 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 C20orf166-AS1-201ENST00000412495 2302 ntTSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 ZNF500-201ENST00000219478 5880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 KCNB1-203ENST00000635465 4114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
CTSSP25774 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.59□□□□□ -0.07
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