Protein–RNA interactions for Protein: P24928

POLR2A, DNA-directed RNA polymerase II subunit RPB1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,970 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
POLR2AP24928 WDR70-202ENST00000504564 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CCDC3-201ENST00000378825 2731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 GJB3-201ENST00000373362 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 HAS3-205ENST00000569188 2170 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RGS10-202ENST00000369103 804 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CXorf40A-211ENST00000450602 1204 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PGAP2-214ENST00000465307 1100 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC105129.2-201ENST00000559536 390 ntBASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL358215.2-201ENST00000639693 946 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ALDH4A1-201ENST00000290597 2124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 C19orf25-207ENST00000588871 2128 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MAPK9-201ENST00000343111 4369 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ACTR2-205ENST00000542850 1429 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SEPHS1-206ENST00000545675 2988 ntTSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 ANKRD17-211ENST00000639793 3486 ntTSL 5 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CLDN5-202ENST00000406028 2548 ntTSL 2 BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.84■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 RBM47-212ENST00000514014 2419 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PTGER3-208ENST00000370932 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PKP3-201ENST00000331563 2809 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 CRCP-201ENST00000338592 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 C21orf58-203ENST00000397680 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 INPP5J-202ENST00000400294 2393 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 DIO3-201ENST00000510508 2102 ntAPPRIS P1 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PCDHB18P-201ENST00000524813 2368 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 UBE3B-212ENST00000540230 1541 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NFIX-214ENST00000592199 1509 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PFDN5-202ENST00000334478 586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 SLC25A24P2-201ENST00000415059 510 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AC100858.3-202ENST00000533496 553 ntTSL 4 BASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 AL022328.3-201ENST00000607943 679 ntBASIC18.83■□□□□ 0.61
POLR2AP24928 PACRGL-202ENST00000360916 2073 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC141586.5-201ENST00000624546 2050 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TM9SF3-201ENST00000371142 6141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SCARB1-208ENST00000544327 1812 ntTSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PDX1-201ENST00000381033 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC068880.1-201ENST00000507289 2297 ntBASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GPR157-201ENST00000377411 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LINC00957-202ENST00000441052 2590 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 EHD2-202ENST00000538399 1766 ntTSL 2 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PRR19-201ENST00000341747 1530 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.83■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 HIST1H2AJ-201ENST00000333151 387 ntAPPRIS P1 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 THEG-202ENST00000346878 1211 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SPNS3-201ENST00000355530 2133 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 MAGI2-AS3-208ENST00000446159 670 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC009720.1-201ENST00000511867 586 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 KC6-205ENST00000599934 556 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RBM8A-206ENST00000632555 751 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FARP2-202ENST00000373287 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 XXYLT1-201ENST00000310380 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC139713.2-201ENST00000641328 2723 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ZNF711-201ENST00000276123 2887 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 JMJD4-207ENST00000620518 2432 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ABHD3-209ENST00000580981 1836 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 IGHM-202ENST00000637539 1683 ntAPPRIS P5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PSMF1-201ENST00000246015 2042 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TXNDC2-201ENST00000306084 1873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 APH1A-203ENST00000369109 1713 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 DRD5P1-201ENST00000456605 1438 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PHF1-201ENST00000374512 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CCL25-201ENST00000253451 953 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 NPPC-201ENST00000295440 500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL138767.1-201ENST00000354527 744 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TMEM243-202ENST00000423734 601 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 DUSP13-205ENST00000464872 684 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC074194.1-201ENST00000505025 622 ntTSL 4 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 IFI27L1-210ENST00000556381 804 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 MIF4GD-206ENST00000579119 856 ntTSL 3 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 RAB11B-202ENST00000594216 894 ntTSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC008403.1-201ENST00000595676 443 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC015967.2-201ENST00000624092 234 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AC006435.4-201ENST00000625037 234 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AL356737.1-201ENST00000634391 234 ntBASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 GATM-201ENST00000396659 2597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TMPRSS9-205ENST00000613480 2568 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 PSEN2-211ENST00000626989 1972 ntTSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 ABHD2-207ENST00000565973 2347 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 OASL-204ENST00000620239 1695 ntTSL 1 (best) BASIC18.82■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 AP003392.4-202ENST00000526453 1359 ntTSL 2 BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TXNRD2-203ENST00000400519 3155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 KLK5-202ENST00000391809 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 TRMT6-201ENST00000203001 2327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
POLR2AP24928 SARAF-201ENST00000256255 2154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.81■□□□□ 0.6
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 28.7 ms