Protein–RNA interactions for Protein: P23219

PTGS1, Prostaglandin G/H synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 599 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PTGS1P23219 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TPD52L2-201ENST00000217121 2362 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 C19orf54-201ENST00000378313 2753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 IFT140-201ENST00000361339 2987 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC002056.1-201ENST00000395613 760 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL121832.1-203ENST00000433121 475 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC005237.2-201ENST00000434368 219 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 BATF2-204ENST00000527716 1230 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL096865.1-201ENST00000606796 927 ntBASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ELP5-201ENST00000354429 1304 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 MAP4K1-203ENST00000586296 1363 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 MPPE1-211ENST00000588072 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 LYNX1-206ENST00000621401 4537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 WTAP-205ENST00000614346 1623 ntTSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 MTFR2-203ENST00000420702 1793 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 RBBP7-204ENST00000404022 1904 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TDRKH-202ENST00000368823 2751 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CEP120-201ENST00000306467 4900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 DENND3-201ENST00000262585 5438 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PDZRN3-201ENST00000263666 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SLC46A2-201ENST00000374228 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 C2orf81-202ENST00000612891 1902 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 RSRP1-201ENST00000243189 1502 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 EPB41L3-203ENST00000400111 4259 ntTSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SFN-201ENST00000339276 1320 ntAPPRIS P1 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TFAMP1-201ENST00000412727 736 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 LINC00404-201ENST00000418660 428 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 YAE1D1-202ENST00000432096 968 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PNPO-202ENST00000434554 1196 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL592309.1-201ENST00000443127 649 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SPDYE11-202ENST00000450699 704 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL135744.1-201ENST00000565098 629 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SPDYE9P-201ENST00000570642 692 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SPDYE10P-202ENST00000612005 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SPDYE8P-202ENST00000612377 668 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CASZ1-202ENST00000377022 7936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TRMT2A-202ENST00000403707 2928 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 REPS1-208ENST00000450536 4537 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 UGT8-201ENST00000310836 4084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ASXL1-212ENST00000620121 5374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 HSD3B7-201ENST00000262520 2200 ntTSL 2 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SMCHD1-201ENST00000320876 8821 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CLDN4-201ENST00000340958 1831 ntAPPRIS P1 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 NAA50-201ENST00000240922 6135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PRAG1-201ENST00000615670 4903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 ORAI2-205ENST00000478730 5531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AL354813.1-201ENST00000526566 2437 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AMHR2-202ENST00000379791 1437 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 KCNJ12-201ENST00000331718 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 NUPR2-201ENST00000329309 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SIVA1-202ENST00000347067 550 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 BLZF1-202ENST00000367807 1295 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 MECP2-203ENST00000407218 1174 ntTSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC018730.1-201ENST00000454183 327 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SERF1A-207ENST00000512649 846 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 GLI4-207ENST00000521682 1082 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 CFL1-212ENST00000531413 636 ntTSL 3 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PTHLH-207ENST00000539239 890 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 TMEM88-202ENST00000574668 510 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 LIM2-202ENST00000596399 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SIGLEC7-205ENST00000600577 616 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PKLR-201ENST00000342741 2083 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 RDX-201ENST00000343115 4491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 SMG1P3-206ENST00000522841 2774 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 LRRC71-201ENST00000337428 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
PTGS1P23219 PPAN-P2RY11-202ENST00000428358 2661 ntTSL 2 BASIC19.11■□□□□ 0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.8 ms