Protein–RNA interactions for Protein: P22307

SCP2, Non-specific lipid-transfer protein, humanhuman

Predictions only

Length 547 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCP2P22307 ELAC2-203ENST00000426905 2671 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PBX3-204ENST00000373489 2775 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TK2-207ENST00000544898 3441 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CD37-201ENST00000323906 1265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CGB3-201ENST00000357383 877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CGB2-201ENST00000359342 627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 IL32-205ENST00000396890 1067 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AL135791.1-201ENST00000429214 826 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 URGCP-206ENST00000446958 365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PTGES3-204ENST00000448157 1017 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LINC01143-201ENST00000449073 625 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 FAM118B-206ENST00000529731 1028 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 Z97055.2-201ENST00000563715 859 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LINC00466-208ENST00000635218 1217 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ALPPL2-201ENST00000295453 2493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PHKG2-201ENST00000328273 1536 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ALPI-201ENST00000295463 2550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AC007495.1-201ENST00000501259 2678 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 COL4A3BP-203ENST00000380494 5651 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 SLC39A13-201ENST00000354884 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RAI1-201ENST00000353383 7662 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 DHFR-201ENST00000439211 3917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TMEM57-202ENST00000399766 3294 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 EDN3-202ENST00000337938 2636 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 BCAR1-206ENST00000535626 2894 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
SCP2P22307 KCNQ2-236ENST00000637193 2983 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CNPPD1-201ENST00000360507 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ALOX15-205ENST00000574640 2422 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CYP4F22-202ENST00000601005 2445 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 DHX33-201ENST00000225296 5618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TICAM2-201ENST00000427199 3049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 EIF2B4-212ENST00000622434 1771 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 UXT-AS1-201ENST00000590504 1525 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 METTL26-202ENST00000338401 544 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CRIP1-203ENST00000409393 677 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 USHBP1-203ENST00000431146 2136 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PXN-AS1-202ENST00000538804 508 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NFATC1-208ENST00000586434 2103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LINC02199-201ENST00000506655 2702 ntBASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CHRNE-201ENST00000293780 2455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 MX1-210ENST00000455164 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AZI2-205ENST00000420543 1366 ntTSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CMTM3-202ENST00000424011 2330 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 IMPA1-201ENST00000256108 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RAPGEFL1-209ENST00000544503 2079 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 GCK-202ENST00000345378 2421 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RAI2-206ENST00000545871 2421 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NPHP3-201ENST00000337331 4362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PRRG3-205ENST00000538575 1303 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CENPN-202ENST00000305850 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 UNC5C-202ENST00000504962 1789 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TRAPPC8-210ENST00000582513 3205 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AC023824.1-201ENST00000562945 2975 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CCDC43-202ENST00000457422 2058 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 MED19-201ENST00000337672 1637 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PRKCSH-205ENST00000587327 2189 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LIFR-202ENST00000453190 4253 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LIM2-201ENST00000221973 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NDUFB2-202ENST00000460088 420 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AZIN1-AS1-212ENST00000520538 476 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AC243965.1-201ENST00000557595 781 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 AC093520.2-201ENST00000561830 333 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 LINC00668-203ENST00000579012 605 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PHOSPHO2-207ENST00000616524 1253 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 CLU-215ENST00000523500 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 MAGEA2-207ENST00000620710 1947 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 RAC2-201ENST00000249071 1482 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PDLIM1-201ENST00000329399 1452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 PRKAG1-217ENST00000552212 1497 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NTRK2-207ENST00000376214 5608 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 TLE6-202ENST00000452088 1883 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
SCP2P22307 FLJ31104-201ENST00000500093 2289 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCP2P22307 NFYC-210ENST00000425457 1536 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
SCP2P22307 BX088651.4-201ENST00000435586 2579 ntTSL 2 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 133.3 ms