Protein–RNA interactions for Protein: P18545

PDE6G, Retinal rod rhodopsin-sensitive cGMP 3',5'-cyclic phosphodiesterase subunit gamma, humanhuman

Predictions only

Length 87 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE6GP18545 LHX9-204ENST00000367391 1623 ntTSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CDCP2-202ENST00000530059 1623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RPS6KC1-208ENST00000614059 4188 ntTSL 1 (best) BASIC10.15□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 APP-208ENST00000439274 2517 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CHTF18-202ENST00000317063 2988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PRKCZ-202ENST00000400921 2294 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DPY19L2P2-201ENST00000312132 4078 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM198B-201ENST00000296530 4985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARPC1B-201ENST00000252725 1551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TRAPPC10-201ENST00000291574 6976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TFAP2A-201ENST00000319516 2035 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NAGK-208ENST00000455662 1778 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC4A7-213ENST00000454389 4159 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PCDHA5-201ENST00000529619 4157 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCDC32-201ENST00000358005 1704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ABHD14A-201ENST00000273596 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SSSCA1-201ENST00000309328 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MRPL12-201ENST00000333676 1028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DUSP15-203ENST00000375966 1077 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RPS9-203ENST00000391752 772 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DUSP15-204ENST00000398083 1212 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DUSP15-205ENST00000398084 1256 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCK-203ENST00000434608 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC078883.2-201ENST00000441212 558 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC097488.1-201ENST00000507834 756 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC083906.2-201ENST00000511578 360 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LY6E-205ENST00000519611 635 ntTSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LY6E-212ENST00000522024 868 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AP003041.3-201ENST00000527151 707 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GRAMD4P8-201ENST00000605465 1115 ntBASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AL160396.2-202ENST00000636692 566 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GRB2-201ENST00000316615 3181 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PCED1B-202ENST00000546455 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC009053.1-201ENST00000566802 2320 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FOS-208ENST00000555686 1496 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LGALS12-201ENST00000255684 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GYG1-201ENST00000296048 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SEPT11-209ENST00000510515 1886 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SLC16A1-207ENST00000538576 4374 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MKS1-204ENST00000537529 2083 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GALNT4-201ENST00000529983 5399 ntAPPRIS P1 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SESN1-202ENST00000356644 2676 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MED20-201ENST00000265350 2438 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARHGAP35-206ENST00000614079 7696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SCYL1-201ENST00000270176 2642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 UBE2I-201ENST00000325437 2832 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 KLF5-201ENST00000377687 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RASA4B-207ENST00000541662 2794 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CHEK2-202ENST00000348295 1771 ntTSL 5 BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SOAT1-204ENST00000540564 6861 ntTSL 1 (best) BASIC10.14□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 MICAL1-201ENST00000358577 3142 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TBC1D3P5-202ENST00000581469 2513 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FRMD5-209ENST00000484674 2319 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 M6PR-202ENST00000536844 2305 ntTSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RTKN-202ENST00000272430 2142 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ORMDL3-204ENST00000579695 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARHGAP6-204ENST00000380718 3632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC005252.3-201ENST00000623855 2258 ntBASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ATE1-203ENST00000369043 4900 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CBLN4-201ENST00000064571 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SIGLEC6-205ENST00000425629 1852 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CCDC63-202ENST00000545036 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 GNL1-201ENST00000376621 7490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 CELF6-204ENST00000543764 1676 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 TRIM29-210ENST00000528870 2217 ntTSL 2 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 DGKE-201ENST00000284061 8660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ZMYM3-207ENST00000373998 6067 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 NPR1-202ENST00000368680 4236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 COX7A2L-201ENST00000234301 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 ATP5C1-202ENST00000356708 1163 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 FAIM-202ENST00000360570 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 PAX3-208ENST00000409828 1254 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 BAALC-AS2-201ENST00000436771 496 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
PDE6GP18545 SPI1-204ENST00000533968 1290 ntTSL 1 (best) BASIC10.13□□□□□ -0.79
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.9 ms