Protein–RNA interactions for Protein: P17812

CTPS1, CTP synthase 1, humanhuman

Predictions only

Length 591 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CTPS1P17812 PDCD1-201ENST00000334409 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 BRD3-201ENST00000303407 5652 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AC107871.1-202ENST00000562767 3389 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PDE12-202ENST00000487257 3040 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MFSD1-202ENST00000392813 2244 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LINC00612-201ENST00000538094 2213 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMEM120A-201ENST00000417509 1444 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 EML2-203ENST00000536630 2791 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PAPLN-202ENST00000340738 5834 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMUB2-204ENST00000538716 1953 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 EXD3-201ENST00000340951 2872 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SUV39H1-202ENST00000376687 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMEM127-202ENST00000432959 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SRPK3-201ENST00000370100 1717 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 AL137003.1-201ENST00000423260 491 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 RBPMS2P1-201ENST00000437762 623 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 POU5F1P6-201ENST00000466990 990 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ASXL1-206ENST00000542461 1068 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TMEM263-206ENST00000550344 925 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 TVP23B-206ENST00000574226 1080 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SPTSSB-204ENST00000617024 1292 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 CACNB3-203ENST00000540990 1814 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ACSL6-201ENST00000296869 2561 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PDZD8-201ENST00000334464 9699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ATG2A-203ENST00000421419 1481 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PRKCD-201ENST00000330452 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 SENP6-205ENST00000447266 6501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
CTPS1P17812 ZCCHC3-201ENST00000500893 3354 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 REXO1L8P-201ENST00000604378 1897 ntBASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 LINC01660-203ENST00000618517 1859 ntTSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PGAP3-201ENST00000300658 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL121758.1-201ENST00000488788 2714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DPP6-202ENST00000377770 3710 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PJA1-201ENST00000361478 2755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CTSO-201ENST00000433477 2954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 OVCH1-AS1-204ENST00000641955 5529 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 EIF4H-202ENST00000353999 2503 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PPP1R27-201ENST00000330261 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 C11orf88-201ENST00000332814 795 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CBR1-202ENST00000399191 838 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AL158071.2-201ENST00000423380 815 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RPL8-207ENST00000528957 1015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DAD1-205ENST00000543337 501 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC009133.1-203ENST00000569039 589 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC217774.2-201ENST00000580347 560 ntTSL 4 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 FHL2-212ENST00000607522 759 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC009093.7-201ENST00000623853 1223 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 COLCA2-206ENST00000638573 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CABP1-204ENST00000453000 1857 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 NRP1-203ENST00000374821 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 MPP1-205ENST00000413259 2195 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ZNF281-201ENST00000294740 4891 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ILVBL-201ENST00000263383 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TBP-202ENST00000392092 1903 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC027796.3-201ENST00000572919 4753 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TSC2-222ENST00000568454 5434 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 DLG4-202ENST00000399506 3185 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ACTN2-207ENST00000546208 5103 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ADD1-201ENST00000264758 4045 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 TPD52L2-209ENST00000611972 2197 ntTSL 3 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 F3-202ENST00000370207 1879 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SLC6A8-204ENST00000430077 1892 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 SH3RF1-201ENST00000284637 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 ZFYVE28-208ENST00000511071 3273 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 KLHL24-201ENST00000242810 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 AC105339.1-201ENST00000440089 1362 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 MOSPD3-201ENST00000223054 1053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
CTPS1P17812 PP14571-201ENST00000404327 934 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 237 ms