Protein–RNA interactions for Protein: P17301

ITGA2, Integrin alpha-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,181 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA2P17301 MTHFSD-203ENST00000543303 1207 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 DHRS4-205ENST00000558263 1089 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 DHRS4L2-207ENST00000558753 556 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 AC013565.3-202ENST00000570120 460 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 MIR3180-1-201ENST00000580374 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 MIR3180-3-201ENST00000584616 94 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 SRSF1-209ENST00000585096 568 ntTSL 4 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 NKAPP1-205ENST00000585790 367 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 MTHFSD-220ENST00000634347 1207 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 CDIP1-207ENST00000564828 1636 ntTSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 AC005329.3-201ENST00000626781 1366 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 AL121845.3-201ENST00000490623 3119 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 ABHD16A-201ENST00000395952 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 SYBU-205ENST00000422135 3226 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 ACTL8-201ENST00000375406 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 TMEM40-202ENST00000314124 2308 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 ITPKB-201ENST00000272117 5822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 BFSP2-201ENST00000302334 1558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.05
ITGA2P17301 AC019205.2-202ENST00000441363 2403 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DGAT1-206ENST00000528718 3711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ABTB1-206ENST00000468137 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 FIBP-202ENST00000357519 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CXCL12-204ENST00000395793 665 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SNHG11-204ENST00000420006 720 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SBDSP1-202ENST00000423945 618 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SNHG11-206ENST00000432153 1181 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ARAP1-AS1-201ENST00000542022 388 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC087641.1-201ENST00000557561 1021 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PGPEP1-209ENST00000604499 769 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NOL12-207ENST00000611699 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 FAM238C-204ENST00000640224 1268 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GRHPR-212ENST00000607784 1704 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 POC1B-202ENST00000393179 3096 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RTN4RL1-201ENST00000331238 3625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CAP2-202ENST00000378990 1812 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KRT85-202ENST00000544265 1387 ntTSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 USP43-201ENST00000285199 4169 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GRM5-205ENST00000455756 7927 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SLC9A7-205ENST00000616978 10024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ULK4-203ENST00000420927 1904 ntTSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CHID1-201ENST00000323578 3374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 RBPMS-204ENST00000397323 2941 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SLC5A7-202ENST00000409059 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PNCK-202ENST00000370142 1525 ntTSL 5 BASIC15.33■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SLC34A1-201ENST00000324417 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ELFN2-207ENST00000613079 8360 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 EPS8L2-231ENST00000614442 3188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SEMA3G-201ENST00000231721 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 GALNT14-201ENST00000324589 2169 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MRPL57-201ENST00000309594 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ASCC3-207ENST00000522650 2828 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC022532.1-201ENST00000624563 1728 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SIK1-201ENST00000270162 4712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CU639417.2-201ENST00000613488 4705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 COMMD6-203ENST00000377615 1793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SLC43A1-204ENST00000528450 2358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 COTL1-201ENST00000262428 1843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC112504.1-201ENST00000623415 1841 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 EPHB4-201ENST00000358173 4329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NDUFS7-201ENST00000233627 1039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 SGF29-201ENST00000317058 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NNAT-202ENST00000346199 1209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DUSP12-201ENST00000367943 1270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DMKN-206ENST00000418261 1257 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 CYHR1-203ENST00000424149 1162 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AP000347.1-202ENST00000435868 847 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MCCC2-205ENST00000509358 1214 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 NDUFB9-202ENST00000517367 636 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 MSRA-206ENST00000521209 814 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 ZBED5-AS1-202ENST00000529014 771 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 H2AFJ-203ENST00000544848 644 ntAPPRIS P1 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 BLOC1S1-204ENST00000549147 1229 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 AC020934.1-201ENST00000588469 739 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 KLK6-204ENST00000594641 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA2P17301 DNASE1L2-206ENST00000613572 1260 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.2 ms