Protein–RNA interactions for Protein: P13224

GP1BB, Platelet glycoprotein Ib beta chain, humanhuman

Predictions only

Length 206 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GP1BBP13224 WDR6-202ENST00000415265 1883 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AMT-206ENST00000458307 1860 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TINF2-208ENST00000558566 1874 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FAM174B-201ENST00000327355 2792 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MAP4K1-201ENST00000396857 2653 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SSB-202ENST00000409333 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZNF133-205ENST00000401790 2642 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ZNF133-206ENST00000402618 2622 ntTSL 2 BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DDX42-208ENST00000578681 4337 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RUSC1-209ENST00000471876 1749 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NFASC-205ENST00000403080 2462 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HLA-F-216ENST00000259951 1635 ntAPPRIS P4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TRPC6-202ENST00000348423 2448 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 BX276092.9-201ENST00000636797 1563 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 COQ6-220ENST00000629426 1538 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RGN-203ENST00000397180 2257 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MTA2-204ENST00000527204 2265 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RRM2-202ENST00000360566 3673 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 USP27X-AS1-201ENST00000437322 2175 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PITPNA-202ENST00000539476 3612 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PAK4-203ENST00000360442 2855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ASL-201ENST00000304874 2143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 C2CD3-213ENST00000539061 2722 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PRDM1-203ENST00000369096 5164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ADAM10-205ENST00000461408 1932 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC004945.1-201ENST00000416738 983 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CDK2AP2P3-201ENST00000422476 372 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KRT18P32-201ENST00000424695 1287 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 HLA-DPB2-205ENST00000435074 1188 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 EEF1E1-205ENST00000507463 654 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CPLX2-206ENST00000512824 518 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FCHSD1-204ENST00000519800 802 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AP001107.2-202ENST00000528650 480 ntTSL 3 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TSFM-210ENST00000550559 897 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MARVELD3-206ENST00000567566 850 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CYP2A7P1-201ENST00000595391 815 ntBASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TBX18-206ENST00000606784 1230 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LINC00623-204ENST00000617702 746 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SYT6-201ENST00000369547 4369 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PLXNC1-201ENST00000258526 7346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CYB5R3-204ENST00000407332 1849 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SPOP-201ENST00000347630 2965 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TTC8-216ENST00000614125 2377 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PPP1R3B-202ENST00000519699 2334 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 RGS3-210ENST00000462143 2759 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 DDX19B-204ENST00000451014 1608 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NCOA5-201ENST00000290231 3220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 LRP8-207ENST00000465675 2670 ntTSL 2 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 NDUFV1-201ENST00000322776 1596 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC073957.2-201ENST00000549241 1562 ntTSL 4 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC006460.2-201ENST00000638173 4744 ntTSL 5 BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PITPNC1-203ENST00000580974 6182 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.28■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AL133338.1-201ENST00000565695 1517 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 WDR4-201ENST00000330317 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FERMT2-203ENST00000395631 3369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CRY2-211ENST00000616080 1936 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ESR2-205ENST00000358599 1899 ntTSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MMP17-206ENST00000535291 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TDRD6-201ENST00000316081 6817 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 MXD4-201ENST00000337190 4056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 KAT2A-201ENST00000225916 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PPP6R1-201ENST00000412770 3961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC30A5-202ENST00000396591 4360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TMEM44-201ENST00000330115 1278 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 SLC18B1-202ENST00000367918 472 ntTSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 ADM2-201ENST00000395737 535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 FAM185BP-201ENST00000443595 716 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 CXCL1P1-201ENST00000502804 216 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC092658.1-201ENST00000505836 891 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TMEM161B-AS1-212ENST00000513011 833 ntTSL 3 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AP003068.1-201ENST00000528887 544 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 AC004233.1-201ENST00000570515 608 ntTSL 4 BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 OR7E47P-204ENST00000575924 449 ntBASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PGLYRP1-201ENST00000008938 720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.04
GP1BBP13224 PRR15-201ENST00000319694 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 WDR53-201ENST00000332629 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SH2D2A-202ENST00000368199 1658 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 EVA1C-202ENST00000382699 1668 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SLC22A20-204ENST00000530038 1673 ntBASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 IQCE-204ENST00000404984 2086 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 SCAI-202ENST00000373549 1968 ntTSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 PRX-201ENST00000291825 5502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
GP1BBP13224 ELMO3-203ENST00000477898 2281 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.27■□□□□ 0.03
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32 ms