Protein–RNA interactions for Protein: P0DO97

CCDC192, Coiled-coil domain-containing protein 192, humanhuman

Predictions only

Length 292 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC192P0DO97 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PPM1J-202ENST00000464951 2474 ntTSL 1 (best) BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC18.73■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PAQR8-202ENST00000442253 4738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CES4A-207ENST00000540947 2284 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SDR16C5-201ENST00000303749 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 NCOA6-206ENST00000612493 4082 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SYT5-207ENST00000590851 3619 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TM2D3-201ENST00000333202 1381 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC073264.3-201ENST00000636941 2577 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 UNC13A-204ENST00000550896 5200 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PCDHA6-203ENST00000529310 5374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ID2-202ENST00000331129 623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 DFFB-203ENST00000341385 572 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CAPG-203ENST00000409670 1183 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SEC61G-203ENST00000415949 732 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC132008.2-207ENST00000454517 770 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 HOXB-AS4-202ENST00000480386 566 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 KNCN-203ENST00000481882 1037 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 BANK1-207ENST00000508653 2115 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC034243.1-201ENST00000520838 587 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AP003555.3-201ENST00000534086 432 ntTSL 4 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CTDNEP1-207ENST00000572043 857 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC036176.1-201ENST00000589905 785 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AL121912.1-201ENST00000603683 238 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 IZUMO4-213ENST00000620263 947 ntTSL 3 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PPT1-215ENST00000641471 2368 ntBASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 HLA-F-218ENST00000376861 1544 ntAPPRIS ALT2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 EIPR1-202ENST00000398659 1795 ntTSL 5 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 HTR1B-201ENST00000369947 2021 ntAPPRIS P1 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CNKSR1-202ENST00000374253 2538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TNKS1BP1-207ENST00000532437 5952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 KCNC2-207ENST00000548513 3026 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CYBA-210ENST00000569359 1415 ntTSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SLC34A1-204ENST00000512593 1912 ntTSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 ZMYND11-208ENST00000397962 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 GPR161-202ENST00000367835 2400 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TRPC4AP-201ENST00000252015 3226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PPIL6-207ENST00000521072 4128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.72■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CAST-224ENST00000508830 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PITHD1-201ENST00000246151 1603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 GRAMD4-203ENST00000408031 2834 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 WDTC1-202ENST00000361771 4275 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PRRT2-214ENST00000637064 2153 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CSNK1A1-202ENST00000377843 2559 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 NOTO-201ENST00000398468 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PHF23-202ENST00000454255 1662 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 VMO1-202ENST00000354194 651 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PRYP5-201ENST00000451909 266 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SLC2A1-204ENST00000460369 541 ntTSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 MIR130B-201ENST00000498589 1093 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC106795.1-205ENST00000512851 1056 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TRAF3IP2-AS1-208ENST00000525151 609 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 RLN3-202ENST00000585987 541 ntTSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CALM3-211ENST00000598871 561 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AP001269.4-201ENST00000609611 512 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC120114.3-201ENST00000611923 658 ntBASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 OPN5-206ENST00000638973 1090 ntTSL 5 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TOMM40-207ENST00000592434 3415 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 SMURF2-201ENST00000262435 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CLN5-208ENST00000636183 6664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 CMKLR1-206ENST00000552995 1890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 TOR4A-201ENST00000357503 4148 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.71■□□□□ 0.59
CCDC192P0DO97 EPHX1-206ENST00000614058 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 ASTN2-201ENST00000288520 2356 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 SPOCK1-202ENST00000394945 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 TRAPPC11-202ENST00000357207 4435 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 SLC29A1-206ENST00000371755 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 KIF18B-204ENST00000593135 2745 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 GLG1-201ENST00000205061 8261 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 SIT1-201ENST00000259608 1231 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 ATP5J-201ENST00000284971 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 MCL1-201ENST00000307940 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 KHDRBS1-202ENST00000327300 2757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 PLEKHA4-202ENST00000355496 2614 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 RIMS3-201ENST00000372683 1408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
CCDC192P0DO97 ISPD-201ENST00000399310 1709 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.5 ms