Protein–RNA interactions for Protein: P0C7Q3

FAM58BP, Putative cyclin-related protein FAM58B, humanhuman

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Length 252 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM58BPP0C7Q3 AC006063.2-201ENST00000640161 1696 ntTSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 PTPRS-205ENST00000588012 5993 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 GCAT-201ENST00000248924 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ENDOV-212ENST00000520284 2500 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 MAGEA2B-201ENST00000331220 1946 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 PABPC4-201ENST00000372856 3016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SGO1-201ENST00000263753 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SNHG17-206ENST00000436764 973 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 DYNC1LI2-202ENST00000440564 1145 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 RNA5SP419-201ENST00000515908 135 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 UBE2Q2P1-205ENST00000559871 534 ntTSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC104758.1-202ENST00000568184 602 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SLC25A6P4-201ENST00000586535 553 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC243547.2-201ENST00000616257 234 ntTSL 3 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 REXO1L3P-201ENST00000622202 1288 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC117500.6-201ENST00000624871 588 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ZNF19-208ENST00000565637 2612 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CKMT2-202ENST00000424301 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 LINC00895-201ENST00000629028 1637 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 C15orf61-201ENST00000342683 4253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TMPO-AS1-202ENST00000548760 3357 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC006538.1-201ENST00000567905 1585 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 EYA2-201ENST00000317304 1540 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SNX19-207ENST00000528555 1506 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC010478.1-202ENST00000559112 2367 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 GPSM1-205ENST00000440944 3633 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.04■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CDKN1A-203ENST00000405375 2267 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TSPAN4-205ENST00000397406 1426 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 USH1C-202ENST00000318024 2237 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 ARHGAP5-205ENST00000433497 3047 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 CALB2-202ENST00000349553 1373 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ELAVL3-201ENST00000359227 4729 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TVP23B-201ENST00000307767 2064 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 IRF1-202ENST00000405885 2061 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ADCY1-202ENST00000432715 1693 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 COPS3-212ENST00000539941 1699 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 GHSR-201ENST00000241256 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 EXOSC4-201ENST00000316052 887 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 MSANTD3-201ENST00000374885 786 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 AC021066.1-201ENST00000549788 647 ntTSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CIRBP-235ENST00000591935 746 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SCN5A-214ENST00000612060 714 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC116407.3-201ENST00000623905 1129 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 APPL1-201ENST00000288266 6058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ATP2A2-204ENST00000539276 4094 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TP53INP1-201ENST00000342697 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 NPHP4-211ENST00000622020 3004 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CCDC94-201ENST00000262962 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ACE-204ENST00000428043 5120 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 ATP6V1B2-201ENST00000276390 2875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 PTPN13-204ENST00000436978 8573 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 ANTXRL-205ENST00000620264 2206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TLE3-223ENST00000560939 3021 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TM2D1-201ENST00000294613 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 SERTAD1-201ENST00000357949 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 TM2D1-204ENST00000371180 1248 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 DHRS4-203ENST00000397075 727 ntTSL 2 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 BX276092.7-202ENST00000422194 696 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 AC098831.1-202ENST00000438821 336 ntBASIC16.02■□□□□ 0.16
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FAM58BPP0C7Q3 TRPC2-202ENST00000526541 1189 ntTSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
FAM58BPP0C7Q3 CIPC-205ENST00000555437 566 ntTSL 3 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.2 ms