Protein–RNA interactions for Protein: O95292

VAPB, Vesicle-associated membrane protein-associated protein B/C, humanhuman

Predictions only

Length 243 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAPBO95292 MDGA1-203ENST00000434837 10736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ANKK1-201ENST00000303941 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SYNM-201ENST00000328642 3960 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CACFD1-201ENST00000291722 2688 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 HMGN1-204ENST00000380749 1383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LCA10-201ENST00000618311 1392 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KIF13B-206ENST00000524189 8745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TPM1-201ENST00000267996 1670 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PSMA8-202ENST00000343848 1675 ntTSL 1 (best) BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TPM1-219ENST00000559397 1655 ntTSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.5■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CARD11-203ENST00000396946 4366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DUOX1-202ENST00000389037 5483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 STAC-201ENST00000273183 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FES-207ENST00000444422 2266 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LRRC57-204ENST00000563454 2407 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 WAPL-202ENST00000298767 6333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FOXS1-201ENST00000375978 1319 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IL9RP2-201ENST00000423948 1312 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 BCAR1-209ENST00000546196 1340 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PPP4R3A-205ENST00000554684 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IL3RA-202ENST00000381469 1476 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CCDC130-204ENST00000586600 1922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SNCAIP-202ENST00000261368 3745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CREBBP-201ENST00000262367 10803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 HINT1-201ENST00000304043 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 C16orf89-201ENST00000315997 1872 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CRADD-201ENST00000332896 1169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MRS2-202ENST00000378353 1740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SUMO1-201ENST00000392244 831 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SUMO1-209ENST00000409712 761 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PIGBOS1-201ENST00000436697 866 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IQCE-210ENST00000438376 2170 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 KRT18P2-201ENST00000447938 1258 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FDX1P1-201ENST00000449115 551 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 BARX1-AS1-202ENST00000454594 307 ntTSL 3 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AP000442.1-201ENST00000533552 769 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TMEM97-205ENST00000583381 578 ntTSL 4 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AL009183.1-201ENST00000603760 355 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC025580.3-201ENST00000617932 1424 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CCNA2-202ENST00000618014 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC004877.2-201ENST00000623941 599 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CDC42EP4-209ENST00000630622 240 ntTSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TMPRSS13-203ENST00000524993 1950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CRYM-AS1-201ENST00000338573 1661 ntTSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 COL26A1-203ENST00000613501 2970 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC105917.1-201ENST00000506637 2539 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MAGI1-202ENST00000402939 4389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SYDE1-204ENST00000600440 3058 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ATP4B-201ENST00000335288 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TSPAN12-202ENST00000415871 1495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC062028.1-203ENST00000447433 1472 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 GRB7-205ENST00000445327 2197 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FBXW9-201ENST00000393261 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 WDR74-205ENST00000525752 1724 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CYP4B1-203ENST00000371923 2110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AL445931.1-201ENST00000412181 2112 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CHCHD3-201ENST00000262570 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 PRR30-202ENST00000432962 1440 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 BIN3-201ENST00000276416 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 GML-201ENST00000220940 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AP000892.1-201ENST00000504906 488 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 NMU-203ENST00000507338 658 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IGLL5-201ENST00000526893 1050 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MRVI1-AS1-203ENST00000529979 784 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 IGLL5-202ENST00000531372 882 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 MAL2-202ENST00000531508 892 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AF131215.3-201ENST00000532453 639 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AP005019.1-201ENST00000545254 664 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RPL18-208ENST00000549920 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RPL18-209ENST00000550645 463 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RPL18-214ENST00000552588 559 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 THTPA-204ENST00000554970 569 ntTSL 4 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 THTPA-206ENST00000556015 535 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CD7-202ENST00000578509 925 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ARMC7-203ENST00000581078 1002 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 TMEM220-AS1-206ENST00000583343 876 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AC055811.1-201ENST00000584203 1231 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 ACAD9-201ENST00000308982 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 OGFOD2-202ENST00000397389 2308 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 DPM2-201ENST00000314392 1542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 RIMS1-210ENST00000491071 5047 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 AHRR-201ENST00000316418 5661 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LTBR-201ENST00000228918 2260 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 LFNG-205ENST00000402506 2268 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 POR-218ENST00000461988 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
VAPBO95292 SAE1-202ENST00000392776 1851 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.8 ms