Protein–RNA interactions for Protein: O75578

ITGA10, Integrin alpha-10, humanhuman

Predictions only

Length 1,167 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ITGA10O75578 KIAA0319L-201ENST00000325722 4789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CCDC120-202ENST00000496529 2415 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PI4KAP1-201ENST00000610959 2425 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SELENOF-208ENST00000616787 1835 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GATA6-201ENST00000269216 3770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AL139400.1-201ENST00000366220 510 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CTRC-202ENST00000375949 898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 RANGRF-203ENST00000439238 1140 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-206ENST00000440815 920 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-207ENST00000444393 892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ITPA-203ENST00000455664 729 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-219ENST00000531965 746 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-223ENST00000534507 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-226ENST00000548476 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 IL32-227ENST00000548652 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 KRT8P23-201ENST00000560090 1207 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GNAO1-210ENST00000569295 930 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC108010.1-201ENST00000605862 1107 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ASXL1-210ENST00000613218 7038 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PTGES3-201ENST00000262033 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SERHL2-203ENST00000340239 1315 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PAX4-202ENST00000341640 2010 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TTYH2-206ENST00000529107 2015 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CHGA-201ENST00000216492 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SH2B3-202ENST00000538307 2062 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 EVPL-201ENST00000301607 6614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 BORCS8-203ENST00000477565 1489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SLC5A2-201ENST00000330498 2271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 OSR2-209ENST00000522510 1528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 NRIP1-203ENST00000400202 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SLC2A6-201ENST00000371897 2301 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 EPB41-205ENST00000373797 2402 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ZSCAN10-201ENST00000252463 2463 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 FLVCR1-AS1-201ENST00000356684 2525 ntTSL 2 BASIC15.32■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 EIF4H-201ENST00000265753 2679 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SLC35F3-202ENST00000366618 2891 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ELMSAN1-201ENST00000286523 8091 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC131160.1-201ENST00000639401 3058 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SLC18B1-201ENST00000275227 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PENK-201ENST00000314922 1199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 YIF1B-201ENST00000329420 964 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 EFNA4-202ENST00000368409 1263 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 NRSN2-AS1-202ENST00000442637 762 ntTSL 3 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AL355140.1-201ENST00000457328 398 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC008267.7-201ENST00000624570 1194 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 LINC00628-201ENST00000628516 1289 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 AC087645.4-201ENST00000638890 792 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GLDC-201ENST00000321612 3900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 FGFR3-204ENST00000412135 3951 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TRAPPC3-210ENST00000617904 1305 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 RAB31-207ENST00000578921 4055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PSMC3IP-202ENST00000393795 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 LINC00963-208ENST00000454968 1403 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CXXC1-201ENST00000285106 2936 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 UNC119B-201ENST00000344651 4404 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 MFSD11-207ENST00000586622 2952 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TVP23C-201ENST00000225576 1527 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 NQO2-201ENST00000338130 1515 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 FUT5-201ENST00000252675 1916 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PRODH-202ENST00000334029 1985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TTC24-201ENST00000368236 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 STK32C-204ENST00000368622 2010 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 BACE1-211ENST00000528053 4083 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 RBM6-210ENST00000442092 2260 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 GLS2-216ENST00000610413 2296 ntTSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TRMT44-201ENST00000389737 2799 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CELF6-201ENST00000287202 3345 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 ZNF703-201ENST00000331569 3349 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 CYP2U1-201ENST00000332884 4944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 TMEM219-201ENST00000279396 999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 STOML1-203ENST00000359750 984 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
ITGA10O75578 PABPC4-203ENST00000372858 2753 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.5 ms