Protein–RNA interactions for Protein: O75452

RDH16, Retinol dehydrogenase 16, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RDH16O75452 IL32-233ENST00000552664 731 ntAPPRIS P4 TSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TRIM29-221ENST00000627238 510 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AL732314.4-201ENST00000627627 515 ntTSL 4 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SCAP-201ENST00000265565 4394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AC110813.1-201ENST00000507934 2209 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SNAI2-201ENST00000020945 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 LTK-204ENST00000561619 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SGPP1-201ENST00000247225 3312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 WDR45-201ENST00000322995 1444 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 MIB2-217ENST00000504599 3311 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 DYM-201ENST00000269445 5049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 ZNF786-201ENST00000316286 3144 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PITPNM2-AS1-201ENST00000506255 2191 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AP1AR-201ENST00000274000 2902 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 FER1L4-210ENST00000615531 5998 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 ZBTB47-202ENST00000505904 2456 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CCDC116-203ENST00000607942 1913 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PLXNB2-214ENST00000614805 1387 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 NOL4L-210ENST00000616976 1376 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SH3BP4-201ENST00000344528 5044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AGTPBP1-201ENST00000337006 4473 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AL589702.1-201ENST00000641229 1509 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 LIN54-204ENST00000505397 2742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 BNC1-201ENST00000345382 4610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PI16-201ENST00000373674 2190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 HECTD1-201ENST00000399332 9134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PELI2-201ENST00000267460 5909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 UPK2-201ENST00000264031 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CABP2-201ENST00000294288 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CD81-202ENST00000381036 880 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 RPL30-202ENST00000396070 440 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SMAGP-202ENST00000398453 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AC108047.1-201ENST00000457407 404 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TVP23B-202ENST00000476139 2989 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 HLA-J-203ENST00000494367 1087 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
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RDH16O75452 AC026150.2-201ENST00000564693 1156 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 COX5A-203ENST00000564811 568 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TRAPPC6A-202ENST00000585934 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AC006116.8-201ENST00000587004 987 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 STXBP2-222ENST00000612033 1188 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 DACH1-203ENST00000619232 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 RAB34-224ENST00000636513 888 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 KLC1-212ENST00000553286 3135 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 FADS2-202ENST00000278840 3630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SEPT8-204ENST00000378699 2289 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 HSD17B7P2-202ENST00000494540 1401 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SLC52A1-202ENST00000424747 2412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PPP1R3G-201ENST00000405617 4907 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TUBGCP6-204ENST00000439308 6078 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 FGFR2-215ENST00000457416 3061 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CYP2R1-201ENST00000334636 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CPNE6-201ENST00000397016 2235 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CPNE6-203ENST00000537691 2233 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TMTC2-201ENST00000321196 5681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PIKFYVE-204ENST00000407449 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RDH16O75452 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SYT3-202ENST00000593901 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
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RDH16O75452 NELFA-216ENST00000542778 2465 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SYT12-203ENST00000525457 1678 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 NGFR-201ENST00000172229 3417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CES4A-206ENST00000540579 1825 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 FBXL12-206ENST00000588922 1843 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 USP13-201ENST00000263966 8323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 DOK4-201ENST00000340099 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SLC22A11-203ENST00000377585 2124 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TDRD6-203ENST00000544460 8887 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 ST6GALNAC6-202ENST00000373141 2424 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PGAP3-211ENST00000619169 2094 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 ADGRB2-203ENST00000398538 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 GRAMD1A-202ENST00000411896 2523 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 DIDO1-207ENST00000395343 8477 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 NRXN2-202ENST00000301894 3535 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 SLC3A2-203ENST00000377890 2161 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TSSC4-202ENST00000380992 992 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 HLA-H-201ENST00000383620 1096 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 CEP19-201ENST00000399942 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 GGCT-205ENST00000409436 954 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 PMS2P2-201ENST00000425039 1128 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
RDH16O75452 TMEM91-205ENST00000436170 864 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
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