Protein–RNA interactions for Protein: O43497

CACNA1G, Voltage-dependent T-type calcium channel subunit alpha-1G, humanhuman

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Length 2,377 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CACNA1GO43497 SLC9A5-201ENST00000299798 3736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CRTAC1-201ENST00000309155 1946 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GOLGA2P9-201ENST00000596977 1937 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 COL18A1-204ENST00000400337 5436 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 L1CAM-205ENST00000370060 5113 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GNA13-201ENST00000439174 4922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 C11orf88-202ENST00000375618 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 IGHV3-49-201ENST00000390625 439 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TMEM191A-209ENST00000452055 788 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TSACC-208ENST00000481479 741 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC124067.4-202ENST00000522471 397 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HS3ST3A1-202ENST00000578576 750 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01703-202ENST00000602806 595 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 USP32-201ENST00000300896 5171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 YAP1-201ENST00000282441 5386 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SPAG9-202ENST00000357122 4761 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RANBP3-201ENST00000034275 1762 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RIC8A-208ENST00000527696 2565 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RHBDF1-201ENST00000262316 2992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DHRS4L2-205ENST00000543805 1334 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PSMD8-209ENST00000602911 1330 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 C14orf93-205ENST00000397379 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DCLK1-203ENST00000379892 2101 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SLC22A23-205ENST00000436008 6641 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FAU-202ENST00000434372 533 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC061961.1-201ENST00000443901 432 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FTLP10-202ENST00000505798 471 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ALG1L13P-204ENST00000523017 765 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ZNF586-204ENST00000598183 603 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TNIP1-221ENST00000610874 2629 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CLASRP-201ENST00000221455 2234 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HS6ST2-203ENST00000406696 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DDX17-211ENST00000640332 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DDX17-212ENST00000640668 2196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CTD-3080P12.3-203ENST00000514376 1757 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DGKZ-202ENST00000343674 3816 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ATP2B1-AS1-201ENST00000605386 3632 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AR-207ENST00000612010 3896 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NKIRAS1-206ENST00000425478 2014 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 EN2-201ENST00000297375 3395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 JADE3-204ENST00000614628 4934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TM4SF19-201ENST00000273695 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ATXN3-201ENST00000340660 1205 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RPARP-AS1-201ENST00000473970 1297 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARTN-209ENST00000479128 471 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ZSCAN10-205ENST00000572548 618 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RNF121-201ENST00000361756 2625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 HDAC10-222ENST00000626012 2607 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARID4B-203ENST00000366603 5946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FNBP1-203ENST00000443566 5227 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SSBP3-203ENST00000371319 1578 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 NFIC-210ENST00000590282 1558 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ELP4-219ENST00000639878 1583 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CYP2W1-202ENST00000340150 2361 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GATB-213ENST00000515812 1893 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PPARD-202ENST00000337400 2041 ntTSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TMEM53-203ENST00000372242 1846 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DOK4-218ENST00000569548 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CFLAR-208ENST00000423241 2128 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DNAJA3-203ENST00000431375 2294 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC00905-202ENST00000588117 1768 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TUBGCP2-204ENST00000417178 4029 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 MCTP1-218ENST00000515393 5396 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TLE4-206ENST00000376552 3695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WNT7B-203ENST00000410058 714 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PSMB5-203ENST00000425762 900 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 AC016723.1-201ENST00000430546 633 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 LINC01056-201ENST00000455711 1234 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DTX4-204ENST00000532982 1708 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 TMPRSS5-207ENST00000540540 2001 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 GSKIP-201ENST00000438650 2140 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 SMOX-205ENST00000379460 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARFRP1-212ENST00000618838 1623 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 DDX39A-201ENST00000242776 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 EID3-201ENST00000527879 1467 ntAPPRIS P1 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 RIC8A-201ENST00000325207 2702 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 FAM76B-201ENST00000358780 3952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 ARHGAP22-206ENST00000435790 2595 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PIF1-201ENST00000268043 2687 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 PRR29-AS1-202ENST00000580942 2926 ntTSL 2 BASIC15.15■□□□□ 0.02
CACNA1GO43497 WNK2-202ENST00000395477 6834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 ATP5H-201ENST00000301587 603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 STARD13-205ENST00000439831 945 ntTSL 2 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AC079296.1-201ENST00000531592 560 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AP000812.2-201ENST00000538934 718 ntBASIC15.14■□□□□ 0.01
CACNA1GO43497 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC15.14■□□□□ 0.01
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