Protein–RNA interactions for Protein: O43172

PRPF4, U4/U6 small nuclear ribonucleoprotein Prp4, humanhuman

Known RBP eCLIP

Length 522 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF4O43172 DAZAP1-202ENST00000336761 2290 ntTSL 5 BASIC25.4■■□□□ 1.664e-7■□□□□ 10
PRPF4O43172 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.434e-7■□□□□ 10
PRPF4O43172 DAZAP1-201ENST00000233078 2160 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.374e-7■□□□□ 10
PRPF4O43172 DAZAP1-211ENST00000592522 2157 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.214e-7■□□□□ 10
PRPF4O43172 ARID1A-205ENST00000457599 6268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.468e-8■□□□□ 10
PRPF4O43172 CREB1-205ENST00000430624 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.41■■□□□ 1.185e-9■□□□□ 10
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PRPF4O43172 CREB1-201ENST00000353267 7588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC9.45□□□□□ -0.95e-9■□□□□ 10
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PRPF4O43172 CREB1-216ENST00000494094 580 ntTSL 26.02□□□□□ -1.455e-9■□□□□ 10
PRPF4O43172 CREB1-207ENST00000445803 651 ntTSL 42.91□□□□□ -1.945e-9■□□□□ 10
PRPF4O43172 PKDCC-202ENST00000401498 1550 ntTSL 528.6■■■□□ 2.173e-9■□□□□ 10
PRPF4O43172 PKDCC-201ENST00000294964 2502 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.743e-9■□□□□ 10
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PRPF4O43172 CALM2-201ENST00000272298 1302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.487e-10■□□□□ 10
PRPF4O43172 CALM2-209ENST00000628793 1103 ntTSL 5 BASIC17.25■□□□□ 0.357e-10■□□□□ 10
PRPF4O43172 CALM2-208ENST00000489742 522 ntTSL 315.31■□□□□ 0.047e-10■□□□□ 10
PRPF4O43172 CALM2-203ENST00000432899 1004 ntTSL 512.79□□□□□ -0.367e-10■□□□□ 10
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PRPF4O43172 CALM2-202ENST00000409563 770 ntTSL 5 BASIC9.3□□□□□ -0.927e-10■□□□□ 10
PRPF4O43172 CALM2-204ENST00000456319 703 ntTSL 25.26□□□□□ -1.577e-10■□□□□ 10
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PRPF4O43172 MKLN1-201ENST00000352689 11156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC3.36□□□□□ -1.872e-8■□□□□ 9.9
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PRPF4O43172 CARS2-209ENST00000535398 1878 ntTSL 222.38■■□□□ 1.173e-8■□□□□ 9.9
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PRPF4O43172 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.035e-11■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 XBP1-203ENST00000403532 1824 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC20.78■□□□□ 0.925e-11■□□□□ 9.9
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PRPF4O43172 XBP1-205ENST00000482720 520 ntTSL 219.8■□□□□ 0.765e-11■□□□□ 9.9
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PRPF4O43172 CCDC142-201ENST00000290418 2835 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.64■□□□□ 0.412e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CCDC142-204ENST00000471713 1035 ntTSL 517.02■□□□□ 0.322e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CCDC142-205ENST00000472962 645 ntTSL 314.85□□□□□ -0.032e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CCDC142-202ENST00000393965 3406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.18□□□□□ -0.142e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 CCDC142-207ENST00000474681 735 ntTSL 513.89□□□□□ -0.192e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 ANKRD17-205ENST00000513908 852 ntTSL 29.9□□□□□ -0.822e-9■□□□□ 9.9
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PRPF4O43172 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.7■□□□□ 0.14e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 NXF1-201ENST00000294172 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.5□□□□□ -0.094e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 NXF1-210ENST00000531579 590 ntTSL 414.24□□□□□ -0.134e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 NXF1-207ENST00000530875 1922 ntTSL 1 (best)13.78□□□□□ -0.24e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 NXF1-211ENST00000531709 4128 ntTSL 1 (best) BASIC11.81□□□□□ -0.524e-7■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 EFEMP2-201ENST00000307998 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.831e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 EFEMP2-220ENST00000533347 1040 ntTSL 222.67■■□□□ 1.221e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PKM-214ENST00000565143 2301 ntTSL 1 (best)13.48□□□□□ -0.254e-9■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 PKM-212ENST00000564440 3016 ntTSL 1 (best)9.53□□□□□ -0.884e-9■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 BRD2-219ENST00000607833 2338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best)14.19□□□□□ -0.141e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 BRD2-208ENST00000464592 1590 ntTSL 510.17□□□□□ -0.781e-6■□□□□ 9.9
PRPF4O43172 DRD4-201ENST00000176183 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.05■■■□□ 2.082e-6■□□□□ 9.9
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