Protein–RNA interactions for Protein: O00124

UBXN8, UBX domain-containing protein 8, humanhuman

Predictions only

Length 270 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN8O00124 CHMP5-201ENST00000223500 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GLUL-201ENST00000311223 4719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PPHLN1-204ENST00000358314 1643 ntTSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 BID-201ENST00000317361 2495 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 BTNL9-201ENST00000327705 3500 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FOXP3-206ENST00000557224 1371 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 WDR81-206ENST00000446363 2968 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CALHM2-202ENST00000369788 1843 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CCDC59-201ENST00000256151 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PES1-202ENST00000354694 2295 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SPCS2-201ENST00000263672 2708 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PRKX-201ENST00000262848 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CACNA2D3-201ENST00000288197 3671 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 RHCE-201ENST00000294413 1591 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CD99-202ENST00000381180 530 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NPM2-203ENST00000397940 1874 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ICAM2-202ENST00000418105 1252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FTCD-AS1-201ENST00000446649 500 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TMEM205-202ENST00000447337 916 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CACNA2D3-206ENST00000474759 3675 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 MRNIP-205ENST00000518235 1244 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 AC091182.1-202ENST00000518765 713 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CYB561D1-208ENST00000528785 1271 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FAM92B-201ENST00000539556 1898 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 TUBB8-201ENST00000561967 1413 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 LITAF-211ENST00000572255 516 ntTSL 4 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 LITAF-215ENST00000574763 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ICAM2-208ENST00000579788 1103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 PRKD2-216ENST00000601806 2906 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SREBF1-201ENST00000261646 4178 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 NIPA2-204ENST00000398014 3130 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GPR161-204ENST00000367838 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 YTHDF3-212ENST00000621413 2370 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 GSKIP-205ENST00000555181 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ADRA1A-202ENST00000354550 1765 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 ARFGAP1-210ENST00000519273 3176 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 REPIN1-202ENST00000425389 2876 ntAPPRIS P3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 B3GNT4-206ENST00000546192 2749 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FAM3D-201ENST00000358781 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FAM131A-207ENST00000450976 1335 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 DHRS7-212ENST00000611054 1321 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SIT1-204ENST00000618781 1317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 FEN1-201ENST00000305885 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 IFRD1-202ENST00000403825 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CAAP1-201ENST00000333916 2791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 CCDC181-206ENST00000491570 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 IRF5-215ENST00000619830 1652 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 SIRT6-201ENST00000305232 1506 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.18
UBXN8O00124 UBAC2-203ENST00000403766 1375 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SRSF2-205ENST00000508921 1390 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RAB9A-202ENST00000464506 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 LRRFIP2-205ENST00000421276 2522 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SCYL1-206ENST00000525364 2584 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 BCL2L12-202ENST00000246785 1431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SIX6-201ENST00000327720 2787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CD55-204ENST00000367064 2760 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SP2-201ENST00000376741 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 CXCL14-202ENST00000512158 1760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 METTL26-201ENST00000301686 794 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ANAPC11-201ENST00000344877 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 METTL26-205ENST00000397666 726 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RNA5SP415-201ENST00000517246 115 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NCAM1-AS1-202ENST00000533638 618 ntTSL 4 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL031432.2-201ENST00000566714 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AL928711.1-201ENST00000570165 459 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 GABARAP-204ENST00000571253 837 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ANAPC11-213ENST00000577747 672 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TCAP-202ENST00000578283 583 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 TMIGD2-203ENST00000600114 489 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC097376.2-204ENST00000609359 627 ntTSL 2 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 MIR155HG-201ENST00000456917 1600 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 ARHGEF10-201ENST00000349830 5590 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HSFX1-201ENST00000370416 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SEPT5-204ENST00000406395 1974 ntTSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PSMD13-212ENST00000532097 1991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC026412.1-203ENST00000507841 2338 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HMGXB3-202ENST00000503427 5275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 HSF5-201ENST00000323777 4094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 C2CD4A-201ENST00000355522 3445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 SFRP2-201ENST00000274063 2032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 WNT2-201ENST00000265441 2907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FOLH1-201ENST00000256999 2635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 NUP58-201ENST00000381718 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 PICALM-204ENST00000526033 3613 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 FUS-201ENST00000254108 5119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 RUSC1-203ENST00000368349 1968 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 C1QTNF1-208ENST00000580474 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
UBXN8O00124 AC005253.1-201ENST00000597411 2001 ntTSL 4 BASIC16.13■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44 ms