Protein–RNA interactions for Protein: E9PL57

NEDD8-MDP1, NEDD8-MDP1 readthrough (Fragment), humanhuman

Predictions only

Length 170 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8-MDP1E9PL57 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MSC-AS1-206ENST00000519751 596 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 REEP4-207ENST00000523293 913 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TPGS2-215ENST00000590842 1239 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PAX3-207ENST00000409551 1782 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MEG3-206ENST00000423456 1771 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DIABLO-206ENST00000443649 2250 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AL138694.1-201ENST00000637731 1689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DDHD1-201ENST00000323669 5503 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 UBE2Q2-201ENST00000267938 3130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FLAD1-203ENST00000315144 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC106886.4-201ENST00000623557 2502 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RXRB-201ENST00000374680 2908 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PACS2-202ENST00000430725 2944 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 OSGEP-201ENST00000206542 2002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C2orf81-206ENST00000640868 2407 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HIC2-201ENST00000407464 6798 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CNTNAP3-201ENST00000297668 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DOLPP1-202ENST00000372546 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MRGPRF-202ENST00000320913 705 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LCE3E-201ENST00000368789 611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TRAPPC3-203ENST00000373163 951 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC8-203ENST00000373559 632 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HDAC8-208ENST00000373583 434 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC01160-201ENST00000441004 768 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ARL6IP1-202ENST00000546206 1107 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NDRG4-247ENST00000568640 1281 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AURKB-214ENST00000585124 1227 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC239800.4-201ENST00000603712 296 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CT62-201ENST00000449977 1825 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CCDC120-204ENST00000597275 2752 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TCF7-204ENST00000395029 3330 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AC022211.2-201ENST00000585075 2527 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ANKRD17-201ENST00000330838 7734 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DRG1-201ENST00000331457 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 VEPH1-218ENST00000494677 1714 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 USP4-201ENST00000265560 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ACOT7-204ENST00000377855 1614 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C6orf47-202ENST00000375911 2475 ntAPPRIS P1 BASIC16.67■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RBCK1-202ENST00000356286 2774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EZR-202ENST00000367075 3096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GABBR1-205ENST00000377034 4527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKCB-202ENST00000321728 2689 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 IMPDH1P4-201ENST00000445028 1534 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ISM1-201ENST00000262487 2593 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NKAIN1-201ENST00000373736 2589 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 THOC5-202ENST00000397871 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PTP4A3-201ENST00000329397 2785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FCRLB-204ENST00000367946 1152 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EDF1-203ENST00000371649 790 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PRKACG-201ENST00000377276 1585 ntAPPRIS P1 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PIN1P1-201ENST00000412108 996 ntBASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LINC00475-203ENST00000417983 703 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 FKBP11-208ENST00000550765 1030 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NFATC4-215ENST00000554661 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NEO1-206ENST00000558964 4441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 COQ9-214ENST00000567933 882 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PRR29-204ENST00000577953 565 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SSH2-210ENST00000582084 560 ntTSL 3 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MATN3-201ENST00000407540 2524 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EVC2-202ENST00000344408 4390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HTR3E-201ENST00000335304 1912 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GBGT1-204ENST00000372043 1935 ntTSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GAL3ST1-203ENST00000402321 1908 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 C1orf43-201ENST00000350592 1610 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 RPS9-207ENST00000441429 1600 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF1B-AS1-206ENST00000631175 1303 ntTSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 MAPK11-201ENST00000330651 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SLC7A2-205ENST00000522656 2274 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 NEK2-202ENST00000366999 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GFOD2-203ENST00000602377 1991 ntTSL 4 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 HIP1R-201ENST00000253083 4539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ARHGAP27-214ENST00000532891 2604 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PTPN12-201ENST00000248594 3406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.66■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 GLRB-201ENST00000264428 3126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 CLCNKB-204ENST00000619181 1544 ntTSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PTHLH-201ENST00000201015 1872 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 SRRM2-201ENST00000301740 9353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 AIFM1-202ENST00000319908 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 EIF3L-202ENST00000406934 2282 ntTSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 DDX1-207ENST00000617198 2257 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 PPEF2-207ENST00000621010 1797 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 TSC2-201ENST00000219476 6156 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LST1-202ENST00000303757 604 ntTSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.65■□□□□ 0.26
NEDD8-MDP1E9PL57 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.65■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.5 ms