Protein–RNA interactions for Protein: B4DU55

ZNF879, Zinc finger protein 879, humanhuman

Predictions only

Length 563 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF879B4DU55 ZFHX2-205ENST00000615307 1972 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ARMC6-203ENST00000392336 1866 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC016757.1-205ENST00000470346 1888 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CABP1-201ENST00000288616 1369 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NEK7-202ENST00000367385 4149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MAIP1-202ENST00000392290 1386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 UNC5B-202ENST00000373192 6451 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 DCTN3-201ENST00000259632 808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM150B-201ENST00000326652 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 QRFP-201ENST00000343079 411 ntAPPRIS P1 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CD1E-203ENST00000368156 861 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RCN1P2-201ENST00000398357 915 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CYCS-202ENST00000409409 974 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NABP1-203ENST00000409510 843 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 GNB2-207ENST00000427895 1146 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ANKRD13D-218ENST00000515828 1111 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NDUFB9-204ENST00000518008 789 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM218-203ENST00000526175 972 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 BMF-207ENST00000559701 630 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC011455.1-201ENST00000593830 504 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC114488.2-214ENST00000609033 813 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MUC1-224ENST00000611577 1023 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP000867.4-201ENST00000641616 219 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SUSD4-204ENST00000366878 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 GATA4-206ENST00000528712 2614 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC097376.2-205ENST00000610159 5334 ntBASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 YPEL3-203ENST00000562641 1941 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PCMTD1-206ENST00000521344 1712 ntTSL 3 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PBX1-215ENST00000559240 2866 ntTSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SERPINB6-201ENST00000335686 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 GUCD1-203ENST00000404664 1606 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AMT-233ENST00000636522 1620 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZNF131-214ENST00000509634 3340 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 BCAT2-209ENST00000599246 1449 ntTSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 BRF1-201ENST00000327359 2292 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 C8orf46-215ENST00000522977 1347 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ARFGAP1-220ENST00000547204 1327 ntTSL 2 BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MYZAP-202ENST00000380565 2181 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RPTOR-201ENST00000306801 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.66□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 NTRK3-202ENST00000355254 2938 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 FBXL5-201ENST00000341285 3385 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HMGA1-202ENST00000347617 1773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SWSAP1-201ENST00000312423 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TNFSF14-202ENST00000599359 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ASIC1-202ENST00000447966 3778 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PIGF-201ENST00000281382 1372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MBD4-203ENST00000429544 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC139530.2-201ENST00000571730 1922 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SEPT9-211ENST00000585930 1387 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CLASP2-203ENST00000359576 7141 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SNX6-202ENST00000396526 3398 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CACNG7-201ENST00000222212 1016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZNF81-201ENST00000334937 610 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 UXT-202ENST00000335890 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MUC1-204ENST00000343256 648 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 EMD-201ENST00000369835 966 ntTSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SDR39U1-201ENST00000399395 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 LSM5-204ENST00000409909 740 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MMP24-AS1-201ENST00000424358 867 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SAPCD2P3-201ENST00000455031 850 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AC087386.1-201ENST00000553658 572 ntTSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PSME1-205ENST00000559123 1033 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 HDDC3-205ENST00000559898 1024 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CMC2-212ENST00000565650 671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SAXO2-206ENST00000566205 340 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RPL19-204ENST00000579260 1051 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM265-201ENST00000615541 995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 REXO1L6P-202ENST00000619970 1078 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 MAP2K3-215ENST00000627447 351 ntTSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 KRT73-201ENST00000305748 2284 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 EIF2AK4-208ENST00000559624 3548 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 FGD5-206ENST00000543601 5768 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PPP2R5D-206ENST00000472118 2963 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ZNF671-201ENST00000317398 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 TMEM25-202ENST00000354064 1965 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CLEC16A-203ENST00000409790 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 SIGLEC16-201ENST00000599858 1437 ntBASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 LATS1-202ENST00000392273 2567 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RBPJ-204ENST00000348160 1752 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 RPAP3-203ENST00000432584 2133 ntTSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 AP002360.1-202ENST00000530460 2462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CGREF1-206ENST00000405600 1346 ntAPPRIS P2 TSL 4 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 ATP5S-201ENST00000245448 1671 ntTSL 1 (best) BASIC14.65□□□□□ -0.06
ZNF879B4DU55 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
ZNF879B4DU55 CD1D-201ENST00000368171 2253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.64□□□□□ -0.07
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