Protein–RNA interactions for Protein: A0AVK6

E2F8, Transcription factor E2F8, humanhuman

Predictions only

Length 867 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
E2F8A0AVK6 JMJD4-206ENST00000615711 2591 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CBX2-201ENST00000269399 1061 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HSD17B10-203ENST00000375304 916 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CSNK2B-203ENST00000375882 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KRT8P39-201ENST00000396270 1433 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM8A3P-201ENST00000427218 844 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZNF346-202ENST00000503039 2774 ntTSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC008677.1-201ENST00000519230 1561 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KPNA2-202ENST00000537025 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CERNA1-201ENST00000559779 908 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ACSM2A-213ENST00000575690 2322 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC254562.3-201ENST00000626627 631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AHR-201ENST00000242057 6276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MANSC1-202ENST00000535902 5831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ST3GAL2-201ENST00000342907 4450 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PANX2-201ENST00000159647 2964 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAGED4-211ENST00000599522 2669 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SMTNL2-201ENST00000338859 1919 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NFIX-209ENST00000587760 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZDHHC19-201ENST00000296326 1306 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PUDP-203ENST00000424830 1334 ntTSL 3 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SENP1-204ENST00000549518 2260 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PCDHA1-203ENST00000504120 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 HOXC5-201ENST00000312492 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CHTF18-220ENST00000631357 3555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CCNA1-203ENST00000625767 1699 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MAPK14-201ENST00000229794 3779 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AHRR-203ENST00000505113 2173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DEPTOR-203ENST00000523492 1397 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NSUN2-201ENST00000264670 3303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 POC1A-201ENST00000296484 1898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM131B-206ENST00000443739 4382 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ITGB1BP1-204ENST00000360635 4859 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FUK-207ENST00000571514 3054 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TCAF2-203ENST00000425618 2448 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SYNDIG1L-202ENST00000554823 2420 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CHFR-203ENST00000432561 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 C21orf58-201ENST00000291691 2975 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GDE1-201ENST00000353258 2958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MEAF6-202ENST00000373073 603 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LRRC37A5P-201ENST00000374304 1103 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC107890.1-201ENST00000422478 521 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC142381.1-201ENST00000426099 345 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AGGF1-204ENST00000506806 1142 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RNA5SP421-201ENST00000516864 134 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KBTBD4-203ENST00000525720 980 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC008127.1-201ENST00000548424 499 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL139011.1-202ENST00000642063 584 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC098591.1-201ENST00000381811 1613 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LFNG-207ENST00000614382 1969 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 NDUFV1-223ENST00000532303 1493 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZFP1-209ENST00000570010 1457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SLC29A2-202ENST00000357440 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GCFC2-202ENST00000409857 2516 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ELN-206ENST00000380553 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 WLS-202ENST00000354777 2037 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FGFR2-207ENST00000359354 1680 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 WDR90-209ENST00000547944 1672 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DUOXA1-202ENST00000430224 1317 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 DMPK-204ENST00000447742 2754 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MANBAL-204ENST00000397151 1503 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MANBAL-205ENST00000397152 1539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 PDK1-203ENST00000410055 2990 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ATP6V0E2-AS1-201ENST00000461019 2973 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 EVA1A-205ENST00000410113 1747 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 STKLD1-201ENST00000371957 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CDK11B-207ENST00000626918 2457 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RAB37-208ENST00000402449 1560 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL671710.1-201ENST00000610245 2349 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 LRP11-201ENST00000239367 3260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SRGAP2B-207ENST00000641863 2367 ntAPPRIS P5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GPS1-228ENST00000624957 1825 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ZDHHC24-201ENST00000310442 4721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 SLITRK4-201ENST00000338017 3357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 ASB16-AS1-201ENST00000585457 2213 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GOLGA2-213ENST00000610329 2212 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 CACNB2-206ENST00000377328 1233 ntTSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC026202.2-201ENST00000439325 672 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AL589923.1-201ENST00000441473 316 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 BCRP1-201ENST00000444246 691 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC125807.1-201ENST00000483097 614 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC140878.1-201ENST00000565277 250 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AP000894.3-201ENST00000582554 351 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 AC104985.1-201ENST00000587528 507 ntTSL 3 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 RPS15-212ENST00000593052 629 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 TMEM114-205ENST00000624696 560 ntTSL 2 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 BCS1L-212ENST00000439945 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
E2F8A0AVK6 GABRD-218ENST00000640949 1684 ntTSL 5 BASIC17.15■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms