Protein–RNA interactions for Protein: Q9Y6R4

MAP3K4, Mitogen-activated protein kinase kinase kinase 4, humanhuman

Predictions only

Length 1,608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MAP3K4Q9Y6R4 IL17RC-201ENST00000295981 2621 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PCDHB17P-201ENST00000539533 2393 ntBASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 KRT6A-201ENST00000330722 2310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 OSGIN1-202ENST00000361711 2230 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TFEB-206ENST00000403298 2162 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AC008764.6-201ENST00000595909 2069 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CHRFAM7A-202ENST00000397827 2794 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 BORCS5-201ENST00000298571 549 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SMIM29-202ENST00000394990 792 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PSTK-202ENST00000405485 1047 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 MB-205ENST00000406324 582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 NKG7-204ENST00000595217 816 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GCSH-209ENST00000639689 2412 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 COBL-202ENST00000395540 2332 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TRABD-202ENST00000380909 2272 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 MPP1-202ENST00000369534 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GPS1-226ENST00000623691 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SCNN1D-201ENST00000325425 2679 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 AL162231.1-201ENST00000421828 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PDE6G-204ENST00000573076 1505 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 BOC-212ENST00000485230 2173 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PHGDH-208ENST00000641023 2096 ntAPPRIS P1 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 STPG3-201ENST00000388931 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01840-201ENST00000421870 571 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 TREML1-202ENST00000426005 981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ZNF789-204ENST00000448667 1055 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 SPTLC1P5-201ENST00000450718 252 ntBASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 C14orf132-202ENST00000553782 536 ntTSL 4 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 NAT9-222ENST00000583476 583 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 DYNC1LI1-204ENST00000432458 1827 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 ST3GAL3-206ENST00000351035 2377 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PITPNM2-209ENST00000546049 1793 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 PNPO-201ENST00000225573 2256 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 EIF2B5-201ENST00000273783 2655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
MAP3K4Q9Y6R4 GJB6-204ENST00000400066 1927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 HMCN2-204ENST00000611173 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CLEC10A-201ENST00000254868 1797 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TCAP-201ENST00000309889 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AIMP2-202ENST00000395236 860 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PEX5L-206ENST00000465751 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 RN7SL555P-201ENST00000584742 339 ntBASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 STPG3-204ENST00000611378 1015 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DIDO1-203ENST00000370366 2383 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 HIBADH-201ENST00000265395 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ACTN3-203ENST00000513398 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 GPR137-212ENST00000539851 1843 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ORAI2-202ENST00000403646 2528 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CSK-201ENST00000220003 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 WT1-205ENST00000452863 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 EGFL6-202ENST00000380602 2385 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 GPR108-202ENST00000430424 2009 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 IDH3G-203ENST00000370093 1662 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SNAP47-213ENST00000617596 1905 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 COX4I1-201ENST00000253452 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ANK1-203ENST00000314214 1185 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CRYBA2-202ENST00000392096 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PTPA-218ENST00000435132 618 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 BECN1-201ENST00000361523 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 EMX2-201ENST00000442245 2710 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01554-202ENST00000436592 2052 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CHD1L-204ENST00000431239 2907 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 CHPF-203ENST00000535926 2634 ntTSL 2 BASIC24.38■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 IGSF8-205ENST00000614243 2191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ELP6-209ENST00000446787 894 ntTSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SEPT7P2-209ENST00000450436 601 ntTSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SELENBP1-201ENST00000368868 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 NPAS3-201ENST00000346562 5847 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 DVL3-201ENST00000313143 5254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC092053.1-201ENST00000605787 1936 ntBASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PRR5-218ENST00000624862 1900 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 NBL1-213ENST00000622566 2109 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ZKSCAN7-205ENST00000426540 2791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 HTRA3-201ENST00000307358 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 LEFTY2-201ENST00000366820 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ACTRT3-201ENST00000330368 2005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 RBM33-205ENST00000392759 1580 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 AC118553.2-203ENST00000639037 2590 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 ISCA1-201ENST00000311534 813 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 SPDYE4-201ENST00000328794 923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 TNFAIP8L2-201ENST00000368910 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
MAP3K4Q9Y6R4 COL5A1-AS1-201ENST00000371813 336 ntTSL 2 BASIC24.36■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms